高等教育管理學作爲一門獨立的學科發展快速，並且在理論上形成了一定的體系，出版了衆多教材與著作；在實踐方面也廣泛運用到高等院校的日常教育管理中，對高等教育管理起到了重要的指導作用。《高等教育管理學》是一部集合了高等教育管理學理論與實踐的著作，包括高等教育行政、高等教育法規、高校管理的資訊化等內容，該書覆蓋了高等教育管理各個方面，對於高等教育管理工作的開展有一定的指導意義。我國衆多專家學者對高等教育管理學進行了多方面的探索，使高等教育管理學從初步的理論體系發展爲成熟的體系。我國高等教育管理學的發展歷經三個主要階段。第一階段是20世紀50—70年代末期，學科萌芽階段。這一時期我國高等教育管理學處於萌芽發展階段，已經有學者相繼開展高等教育管理的相關研究。書籍《中國高等教育研究50年》一書收錄了1980年發表的關於高等教育管理各個方面的文章共計百餘篇，主要內容以工作經驗總結爲主，對理論層面進行探索的文獻較少。第二階段是20世紀80年代到1996年，學科創始階段。
在這一階段我國高等教育管理主要從兩個方面進行了研究：一是80年代期間針對如何實現高等教育管理的科學化進行研究；二是90年代初期、中期主要從理論層面探索我國高等教育在快速變革狀態下所出現的衆多問題。20世紀80年代我國高等教育處於大發展階段，高等教育規模出現了巨大的增長，形式也逐漸多元化，高等教育的層次與結構都出現了變化，在執行機制方面也進行了一系列改革。高等教育管理在改革過程中遇到一系列問題，要解決這些問題就需要開展實踐探索，而實踐探索又急需理論的指導，因此高等教育管理理論必須迴應高等教育改革過程中遇到的一系列問題。基於此，我國高等教育管理學的研究範圍產生了新的變化，同時出現了創新熱點。1987年4月舉行了“全國高等教育管理學理論體系研討會”，會議上提出了建立高等教育管理學體系的倡議。至此，高等教育管理學體系建設成爲了熱點，出現了大量高等教育管理學相關的理論著作，這些著作對高等教育管理理論的發展有着重要的推動作用，並且代表着我國學者對高等教育管理學體系的建設有了更深一步的認識。在這一階段我國高等教育管理學學科正處於初創的關鍵時期，學科研究擁有以下特點：一是將高等院校與高等教育管理作爲研究對象，開始揭示高等教育管理工作中的內在規律，對於高等教育管理實踐工作有一定的指導性；二是總結了新中國成立以來高等教育管理工作的經驗，詳細提出了高等教育管理工作規範，具有一定的實用性；三是高等教育管理學如火如荼的開展激發了高教管理工作者的積極性，並且成立了高等教育管理研究會，對於高等教育管理學起到了一定的推動作用。第三階段是1997年至今，處於理論累積階段。這一階段高等教育管理學的研究與成果都出現了明顯的變化。
我國第一部教育管理學理論體系專著《高等教育管理學》出版，建立了高等教育管理學的理論體系，初步實現了高等教育管理學科體系從經驗體系朝向理論體系的進步。我國高等教育學的理論問題得到進一步的深入研究。學者開始關注高等教育管理學科建設中的'理論問題，尤其是強化了高等教育管理學理論的研究生培養。這一時期還翻譯了一批國外先進的高等教育管理理論著作，使我國高等教育管理理論研究更加豐富，內容更加多元化。《高等教育管理學》提出，我國高等教育管理學在未來的發展過程中要進一步建設具有中國特色的高等教育管理學體系。我國高等教育管理學必須要具有中國特色，以便有針對性地指導高等教育管理工作。
在高等教育管理學發展的幾十年裏，我們運用了許多先進的管理理念，初步建立了高等教育質量保障體系。我國在繼承與創新國外高等教育管理學理論上還需要進一步總結經驗，結合我國高等教育管理的實際情況，逐步構建適應中國國情，能夠爲我國高等教育管理服務的體系。當前高等教育管理學的理論與實踐存在着客觀差距，高等教育管理學理論要深入高等教育實際，深入挖掘問題，總結經驗，進一步歸納相關理論，最終將理論服務於高等教育管理實踐。在高等教育管理體系中要平衡好理論與實踐的問題，切忌爲了片面建立理論體系而忽視對實踐的要求，同時也要在實踐中結合理論來強化實踐的科學性。