一、把握科學探究的本質———自主性
探究性學習，強調的是學生自主學習、自主發展，教師是探究性學習的組織者和協助者，而不能過分地強調教師的主導作用。在學生遇到困惑時，可向學生提供必要的支援與幫助。探究性學習一般包括：提出問題、作出假設、制定計劃、收集證據、處理資訊、作出解釋、論證過程、獲得認識並交流探究結果。在這一系列過程中，都要落實學生的自主性，教師不能干預，更不能代辦。落實自主性，就是落實探究性學習的學習目的。在自主探究過程中，學生的探究能力、嚴謹規範和不怕困難的態度、主動發現問題的意識、積極創新的精神，都會最終得到實現。教師在探究性學習過程中應扮演好組織者、引導者的角色，並能夠把自己擺在與學生平等的位置上，可以與學生共同探究、共同學習。這樣學生探究的自主性會更加凸顯。
二、突出探究式教學的重點———過程性
“過程性”是探究性學習的的重點，規範探究的過程性就是要關注學習過程中學生思維方式的變化，得到怎樣的體驗與感悟，對資訊資料怎樣整合，強調的是過程性。在整個學習過程中，學生提出問題、做出假設的能力得到加強；學生收集資料、分析資料、整理資料、處理反饋資訊的能力得到提高。交流與合作的能力得以強化。不過要注意的是，提出問題、作出假設、制定計劃、收集並分析整理相關數據、得出結論及表達交流是科學探究的一般過程，而絕對不能把這一般過程作爲固定的模式來要求學生。這樣會束縛學生的手腳，從而違背探究的目的。教師在評價探究結果時，一定要以形式評價爲主，更要關注學生的自我評價及相互評價，決不能以結果的成敗來評價學生。鼓勵學生重視探究過程，讓他們在探究中學會交流與合作，在探究過程中真正得到能力的提升。
三、在探究過程中，要突出學生的主體地位
學生是自我發展的主體，教師已不再是傳道、授業、解惑的長者，而是課堂的組織者、引導者。在課堂上，教師要充分信任學生，建立平等和諧的師生關係，關注每一位學生，啓迪他們的思維，調動他們學習主動性、積極性。引導他們勇於動腦、動口、動手的習慣。培養他們能夠從多角度、多方向去分析問題、質疑問題、主動探索知識規律的能力。教師在探究活動中，一方面，要給學生充分參與設計、討論、操作、表現自己才華的機會，另一方面，要注意傾聽學生的意見，吸納學生的觀點，不強求一致的標準答案，而更重要的是要充分發揮學生的聰明才智，激發學生的創新精神，讓學生自己來動手操作，推導過程，領悟發現、得出結論，培養學生科學素養，體驗學習生物學的快樂。透過探究活動，一方面增長科學探究能力，獲取科學知識，形成尊重事實、善於質疑的科學態度，另一方面也能夠培養他們主動的瞭解生物科學發展的`歷史。隨着資訊技術的不斷髮展，學生獲得知識資訊的渠道多樣化，有些教師在上課時明顯感到自己的知識儲備不足，於是個別教師生怕學生提不同的意見，影響教學進程，甚至惟恐被學生問住而失去面子或出“亂子”，不敢放開課堂。一旦出現與自己設計的思路不同的，馬上制止或提示，把探究性學習變成只是爲了應付公開課、檢查，熱熱鬧鬧地走過場，學生還來不及放開手腳，探究就已結束，成了爲完成探究形式而進行的探究。這樣的實驗探究過於形式化、簡單化，反而束縛了學生的手腳，使學生無所是從，限制了學生的自由發揮。這就要求教師要潛心鑽研新教材，博覽羣書，注意蒐集與生物學相關的資料，不斷提升自己的專業知識，拓寬知識面，還要充分理解探究活動的設計意圖，透過探究活動要明確準備培養學生怎樣的能力、達到什麼樣的目的。這樣可以避免在課堂上草草收兵或無法控制，減少在教學中出現探究只有形式，學生主體作用沒有得到發揮，更沒有落實探究性學習實質的情況。