由於計算機的運算速度快、計算精度高、提供資訊全面，因而大大提高了會計工作的質量，改變了會計工作的面貌，會計覈算和會計管理的環境發生了很大的變化。會計電算化以其高效、自動、方便、準確和及時等優點正日益受到廣大會計人員的歡迎。目前，我國會計電算化的普及及發展很快，但隨着會計電算化的飛速發展，相應地產生了許多新問題。筆者就這些問題作些探討，以求共勉。
一、會計處理錯誤的隱蔽性
在手工操作中，操作人員要進行證證，賬證，賬賬，賬表的核對才能報送報表。因此一般非人爲性錯誤比較容易發現並糾正。而計算機操作中，只有憑證的錄入需要覈對，而賬證，賬賬，賬表不再需要覈對，由計算機自動生成。對一些串錄或非金額性錯誤只有在對賬時或再次檢查時才能發現，因此，應加強對憑證錄入工作的審覈，不僅要對原始憑證與記賬憑證進行覈對審覈，而且要在計算機上結合明細賬進行審覈，以防串錄現象。
二、數據備份隱患多
在會計電算化法規中曾明確規定，實現會計電算化的單位應堅持每天備份，且要雙重備份，並分處分人保管。但在實際工作中往往出現以下幾種情況：
1.部分單位不能堅持每天備份，致使機器一旦出故障，部分賬務數據丟失。
2.備份的數據盤沒有定期檢查，一旦發生問題沒有相應補救措施。
3.數據備份沒有符合要求的存放場所，容易導致軟盤被磁化，發生數據丟失現象。
三、財務數據的安全性難以保障
目前市場上有數百種會計軟件，有些單位還使用自己開發的軟件，各軟件的水平參差不齊。一些企業使用的軟件安全性與保密性存在着諸多問題和不足，使得舞弊者有機可乘；許多軟件缺乏操作日誌記錄功能，對操作人、操作時間和操作內容沒有具體記錄，出現問題不便於追究責任；另外，數據庫缺少必要的加密措施，可以很方便地從外部開啟和修改，特別是一些商業軟件爲了佔領市楊，爲用戶提供修改以前年度賬目等功能。這些都爲舞弊提供了便利。
因此，企業要完善和健全電算化內部控制制度。鑑於採用電算化，原有手工操作下的內部控制制度部分喪失作用，同時計算機數據處理易於篡改、舞弊等問題，必須採取嚴密有效的措施。如：健全管理制度，授權控制制度，建立操作時序控制制度及操作日誌記錄控制制度等措施。
四、沿用傳統的會計分工模式不利於會計電算化的內部控制和分工協作
目前，大部分單位實現會計電算化後，會計人員的分工仍按照原來的手工模式進行崗位設定，這種分工模式不利於會計工作的內部控制和電算化的有效發展。因此，應建立職能分工制度。系統維護員、操作員和數據管理員應合理分工，相互制約，相互監督。
根據會計電算化工作要求，企業應配備以下人員：操作員及檔案管理員各一名，系統管理員、系統維護員及審覈員各一名。
五、會計電算化歸檔工作沒有引起足夠重視，資料保管期限受到限制
按《會計電算化管理辦法》規定，電子計算機替代手工記賬後，其會計憑證、會計賬簿、會計報表等會計檔案要打印輸出，而且要按照《會計檔案管理辦法》的規定執行。但目前一般實現會計電算化的單位，其會計檔案都是透過針式打印機打印出來的，經過一段時間後，字跡往往會褪色，到不了規定的儲存期限，字跡就難以辨清。爲了保證財務數據的安全性，應明確要求所有財務資料全部用激光打印機打印，並裝訂成冊，隨同電算化備份資料一併儲存。
對電算化資料保管應提出明確的存放要求和定期檢查要求。明確要求企業配備必要的場所保管軟件。檔案管理員應熟悉這些條款，並按規定保管。財政部門可加以研究並對原有規章作必要的修改。單位應當建立計算機檔案管理制度。爲了防止非法改動數據，必要時可把計算機檔案定義爲可讀檔案、專用檔案或保密檔案，重要的檔案予以加密，以加強檔案數據的保護。
六、有些單位對會計電算化工作重視程度不夠
目前，有些單位會計電算化開展的程度非常低，其中一個重要因素是部門單位領導和會計人員對會計電算化工作的重視程度不夠。部分會計人員認爲實行會計電算化要從頭學起，以至於有些單位花錢買了計算機和軟件，卻沒有真正使用。
因此，企業應加強會計電算化人才培養。由於會計電算化是一門融計算機學、管理學、會計學、資訊學於一體的.應用技術，雖然大多數會計人員已接受計算機等級培訓，但與實際應用能力要求還有較大差距。具體表現在以下兩方面：
一是缺乏既懂會計又熟悉計算機的人員，這勢必會影響我國會計電算化的進程，因此單位一方面要引進人才，另一方面是對現有的會計人員加緊培訓。
二是會計電算化培訓內容滯後，實用性較差。目前的會計電算化培訓教材一般落後於會計覈算對電算化的要求，會計人員透過培訓所學的知識回去後難以適應工作需要。
七、同一行業內部財務軟件的使用情況混雜
部分行業在開展會計電算化的過程中，沒有從整個行業角度考慮。下屬各單位使用的財務軟件品種多，各種財務軟件的數據接口、使用方法不一樣，導致報表彙總、數據查詢、數據傳輸的不方便。對此，財政主管部門可以規定某些特殊行業必須使用指定的財務軟件，這樣國家可以方便地透過網絡進行財務檢查、專用資金使用情況分析，單位也可以利用網絡及時地進行財務報告的傳送。
八、會計軟件的開發和應用不太成熟
目前我企業應用的財務軟件在使用過程中存在問題較多，難以適應會計處理過程中的各種情況。主要有資產重組調賬難，業務調整不能隨經濟業務的變化隨時調整等，制約了會計電算化的應用。會計軟件應用過程缺乏系統的培訓，導致財務人員應用軟件時出現一知半解的情況。因此，有關部門應儘快地制定出一些具體法規加強對財務軟件銷售公司的管理，進一步規範會計電算化市場。
九、會計電算化市場有待進一步規範