透過對我國農產品物流文獻的梳理，筆者發現現階段的研究主要集中在五個方面：農產品物流重要性、特點和作用的研究（丁俊發，2002；厲以寧，2003），誇大發展農產品物流產業；農產品物流體系和制度研究（侯立軍，2002；王新利，2003；黃祖輝，2005），誇大農產品物流體系的完整性和制度創新；農產品物流模式研究（夏文匯，2003；王新利，2004；劉聯輝，2006），誇大採用第三方物流，大力發展農產品配送；基於供給鏈的農產品物流研究（丁華，2004；朱毅華，2004；龐勝明，2005），誇大農產品物流內外部整合和供給鏈整體優化；農產品物流環境和政策研究（李家曦，2005；陳紹慧，2006），誇大物流基礎平臺建設和政策扶持。而關於農產品物流組織方面的專門研究很少，主要是圍繞第三方物流企業和配送中心組織的建設與發展（杜小芳，2003；劉丹，2005；武雲亮，2006），其它相關研究，如物流中介組織、產銷一體化組織、同盟或虛擬組織等方面研究多散見於農產品流通和農業經濟文獻中。
從組織發展現狀來看，我國農產品物流組織的題目主要有：原有的商糧供企業仍然是農產品物流（特別是大宗農產品）的核心氣力，但企業制度落後、物流功能單一，很多隻能算是傳統的儲運企業；個體私營運輸類企業正在成爲農產品物流的重要氣力，但是規模小而且分散，組織化程度很低；固然一些地區已經出現了農產品物流合作組織、同盟組織以及網絡組織等新型組織形態，但總體數目較少，並且多處於發育的初期，物流功能不夠完善；農產品物流組織之間的分工協作程度低，基於供給鏈的競爭機制尚未形成。因此，加快農產品物流組織創新，培育多元化的農產品物流主體，構建高效的農產品物流組織體系，是發展農產品物流的現實要求。
農產品物流組織創新的理論分析
（一）基於交易用度理論的分析
從交易用度理論的角度出發，組織創新就是組織規制交易的方式、手段或程序的變化，其動力是節省組織內部治理交易和外部市場交易的用度。農產品物流交易用度的大小將直接影響農產品物流交易的形式、物流組織的邊界以及物流組織模式的選擇，創新就是要尋求能夠有效節約交易用度的農產品物流交易方式及其相匹配的組織形式。
1.有限理性和機會主義行爲發生和影響的程度。有限理性和機會主義行爲是交易用度理論的兩個關於人性的基本假設，是影響或決定交易用度的基本因素。只要不確定性或複雜程度上升到一定程度，經濟主體就很難對交易活動做出充分公道的決定和選擇；組織創新就是要構建能夠促進相互交流和學習的先進組織，從而進步經濟決策主體進行科學公道決策的`能力，減少因“有限的理性”而產生的交易用度。我國農產品物流領域的資訊不對稱程度較高，進階運營治理人才嚴重缺乏，組織化和運作規範化程度較低，如何減少因“人或組織”有限理性和利己行爲而產生的交易用度，應該成爲農產品物流組織創新關注的重點。
2.物流組織交易用度的構成及其變化的趨勢。交易用度是指協商、談判和履行協議所需要的各種資源的使用用度。農產品物流交易用度主要包括：農產品物流組織發現需要其提供物流服務的消費者（包括農戶、農產品消費者和農產品流通企業）和尋找其他交易夥伴的本錢；瞭解提供的農產品物流服務的價格等資訊方面的本錢；與交易對方討價還價的本錢；訂立提供物流服務契約的本錢；履行契約的本錢；監視契約履行和制裁違約行爲的本錢。農產品物流組織創新既要重視物流交易用度的大小與構成，同時應考慮組織與物流交易用度變化趨勢相適應，組織自身規模的擴展和資訊化水平的進步等都會影響交易用度的變化，外部環境變化也會帶來交易用度的變化。