一、新高校財務會計制度下的執行與管理問題
(一)財務經費以及專項補助存在不合理之處
由於目前我國高校的財務經費以及專項補助方面存在着許多不合理的地方，因此對高校的財務管理水平造成了嚴重的影響。財務經費對於高校而言，其主要的作用在於保障高校教學與科研工作的正常開展，並且完成一定的任務，主要包括了兩個方面的費用：人員經費以及公用經費。專項補助針對的是完成高校特定的任務或者發展目標，通常這部分經費不在高校基本支出經費的範圍內，但是會被納入年度項目支出計劃當中。在具體的實踐過程中，項目支出佔用了大量的資金，大幅度增加高校的固定資產數量，而對這些固定資產的維護費用也不斷增加，從而很可能導致學校的基本經費嚴重不足還進入了惡性循環。
(二)新高校財務會計制度對財務會計部門職能帶來了一定的影響。
在傳統的高校財務會計制度當中，其會計覈算基礎主要以收付實現制度爲主，容易造成會計資訊缺乏真實性以及全面性，當時的高校財務部門的.主要職能是會計覈算方面。而新的高校財務會計制度引進了權責發生制，其不僅要求財務部門具有會計覈算方面的職能，而且還要求可以成功籌集到所需的資金，對財務管理的風險進行準確的預測與控制，以及監督管理經濟業務，由此實現財務部門職能多樣化的目的。
(三)新高校財務會計制度對預算編制體系產生影響。
在傳統的財務會計制度下，高校的預算管理活動內容主要是作爲行政事業單位來進行預算管理，沒有從高校自身的特殊性以及實際情況來進行預算的管理，脫離了現實。在新高校財務會計制度下，高校的會計科目與預算科目是並行設定的，同時對於應收賬款、應付賬款以及基建等進行預測，而且基建是與行政帳戶合併預算的。由此，新的高校財務會計制度爲高校財務部門的預算制定以及執行帶來了一定的難度。
二、如何改革我國高校財務會計制度
(一)應當注重樹立正確的思想觀念來做好高校財務會計執行與管理的工作。
思想觀念決定一個人的行爲。只有高校管理者以及各級財務部門工作人員在思想觀念上全心全意接受了新的高校會計制度，纔有可能真正用心去落實其措施。所以，如果管理者與員工缺乏對新的高校會計制度的深刻認識，難以從根本上落實新的高校會計制度措施。新的高校會計制度的改革力度體現在多個方面的變化上，包括了會計覈算方面、財務管理方面、資產管理方面等，所涉及的範圍極爲廣泛，必須要求高校各個部門共同配合協調，以達到共同改變的目的。所以，首當其重的就是高校各級部門人員必須樹立起正確的思想觀念，認真面對新高校會計制度所帶來的改革問題，從思想觀念上認同改革的思想中心，從實際行動上支援改革的措施，從而確保新高校會計制度下高校財務會計管理工作的順利開展。
(二)應當重視對預算控制管理工作的加強。
在新的高校會計制度下，預算控制管理的作用有所強調，財務預算作爲高校全面預算中的關鍵組成部分，其關係到高校教育事業以及科研事業發展的戰略目標是否能夠得以順利實現，不僅僅與我國現今的社會主義市場經濟的機制相對接。由此可見加強高校預算控制管理工作具有極爲重要的意義。爲了做好這方面的管理工作，高校應當建立科學完善的預算管理控制體系，重視建立嚴格有效的考覈制度，從而讓預算工作從編制到執行都有據可依，提高了預算管理控制工作的效率，也促進了預算工作的嚴肅性以及科學性的提高。
(三)加強財務會計管理的法律意識。
爲了保障高校財務會計管理工作的合理實施，企業應當注重強化會計工作人員的法律意識，嚴格要求會計工作人員在工作中必須遵紀守法。只有改變並強化了會計工作人員的法律觀念與意識，才能夠真正意義的實現企業管理質量與水平的全面提高。
(四)提高財務會計管理工作人員的素質與能力。
從財務會計工作人員的思想道德素質進行改善，要求其具備良好的專業的職業素質，同時注重提高其專業的財務會計操作能力，透過構建高素質的財務會計管理團隊來實現會計工作的高效率性與專業性。
(五)加強財務會計工作的外部監管。
在我國社會主市場經濟高速發展的階段，法制經濟是我國市場經濟的主要方向，只有實行有效的監督，方可規範高校財務會計工作中不合法的行爲，透過健全會計法律法規，來保證高校財務會計管理工作的質量，根本性解決我國高校財務會計管理工作中所存在的種種問題。
三、結語
完善的管理體系能夠促進高校財務會計管理工作的順利開展，爲高校財務會計管理工作的正常執行提供了保障。高校應當建立健全的管理體系，爲會計工作的開展提供製度上的保障，從而爲高校的決策提供有效的依據，並且促進決策的有效落實。在建立管理體系的過程中，應當注意從高校自身的教學事業以及科研事業發展實際出發，切忌脫離實際情況制定相關的制度體系，方可保證所制定的制度與體系具有可行性。只有實現了管理體系的完善，纔可以從根本上產生管理體系的保障作用，發揮有利於高校管理與發展的功能。