內部審計是銀行內部控制系統中不可缺少的重要組成部分，在各個方面支援銀行內部控制職能的發揮，在改善銀行內部控制環境、評估銀行風險、促進資訊溝通、監督銀行經營活動等方面發揮着積極的作用。
一、內部審計與內部控制制度建設的聯繫
（一）內部控制是商業銀行爲實現經營目標，透過制定和實施一系列制度、程序和方法，對風險進行事前防範、事中控制、事後監督和糾正的動態過程和機制。內部審計則以促進建立和健全有效的內部控制、督促審計對象有效地履行職責爲宗旨，所以內部控制是內部審計的工作對象，內部控制評價是內部審計的一項審計內容。同時，內部審計作爲內部控制的一個重要組成部分，它的職責是履行監督職能，檢查內部控制應當建立的“控制點”是否齊全、合理、是否發揮作用，評價內部控制的完整性、合理性和有效性。對存在缺陷或無效的內部控制，內部審計人員應提出改進和完善建議，並督促有關部門執行，所以內部審計又是對內部控制的再控制，實際上就是對內部控制的評價過程。
（二）完善的內部審計制度是銀行內控建設的重要內涵。建立、完善符合現代管理要求的內部組織機構，形成科學的決策機制、執行機制和監督機制，確保銀行經營目標的實現，是內部控制所要達到的基本要求。在銀行內部建有獨立的內部審計機構、完善的內部審計制度就是達到上述內部控制目標的重要手段，更是銀行內控建設必不可少的內容。
（三）內控目標的實現離不開內部審計職責的履行。堵塞漏洞、消除隱患，防止並及時發現和糾正各種欺詐、舞弊行爲，保護銀行財產完整，是內部控制所要達到的基本目標，同時這也是內部審計機構的基本職責。透過內部審計職責的履行，能夠確保銀行內控目標的實現。
（四）內部審計的相對獨立的地位可以推進銀行內控的科學合理和健全有效。內部審計的獨立性能夠確保公平、公正的對內控系統的健全性、遵循性、科學性，實施監督檢查、考覈評價，併發揮其建設性職能作用，能夠更好地保證銀行內部控制實施的科學性和執行的有效性。
二、內部審計對銀行內控制度的作用
(一)內部審計對內控制度有維護及監督功能
內部審計從銀行內部管理要求出發,對銀行整個內控制度系統進行檢查和評價,提出完善和修改的建議。一是對於內部控制制度不健全的單位和部門,必須有相應的組織進行內部控制審計,以加強和完善內部控制制度，起到一種健全完善的作用。二是無論內部控制制度健全與否,內部控制制度執行檢查和監控工作都是必須的,否則內部控制功能難以實現,這就要求內部控制體系中必須有一種相應的機制來承擔這種功能。三是內部審計對銀行各級單位和部門的內部控制進行檢查和評價,能夠及時將審計發現問題向恰當層次的管理人員通報,以便及時採取行動,糾正因控制制度缺陷所帶來的不利後果,管理層應根據實際情況加以完善,使之符合內部管理需要。
(二)內部控制制度的設計和完善是內審工作的重點
銀行的內部控制制度是按照一定的職能,根據一定的目的,由有關的控制點所構成的控制系統。因此,銀行內審部門不僅要對內部控制進行審計,還要進一步地將內部審計融入內部控制制度的建設中,把內部審計當作建設內部控制制度的重要手段,在重視檢查督促其執行的同時,更重視如何改造完善內部控制制度體系。
(三)內部審計爲銀行內部控制的有效性提供保證
內部審計在對內部控制制度檢查時不可忽視對已建立的內控制度執行情況的檢查,主要檢查控制點是否嚴格執行制度要求,因銀行各項管理與業務活動的情況不斷變化,管理人員、業務人員也會有調動,所以內部審計對內控制度執行情況的檢查是一項經常性的工作。
三、內部審計在銀行內控制度建設中發揮作用的途徑
內部審計既是內部控制系統中重要的一個子系統，又是內部控制體系有效性的確認者，它參與銀行內部控制體系建設，對實現內部控制目標起着重要的作用。
（一）審查與評價控制環境
控制環境的優劣直接決定着銀行的各項控制措施能否執行及執行的效果。如果控制環境不好,一方面很難建立完備的內部控制;另一方面即使建立了完備的內部控制制度,也不會取得好的效果,也照樣出問題。法人治理結構的健全性和有效性;組織各階層人員的知識與技能;組織結構和職責劃分的合理性;重要崗位人員的權責相稱程度及其勝任能力;員工聘用程序及培訓制度;管理權限的集中程度;員工業績考覈與激勵機制。
（二）審查與評價風險管理
在現代市場經濟條件下,銀行內部案件屢禁不止的根本原因是其沒有很好地控制住風險。內部審計重點審查被審單位抗風險的能力;是否建立風險應急應對機制;是否定期組織對高風險項目、重要管理崗位和資金流通環節等可能發生災害性事故的防範和應對演練。
（三）審查與評價控制活動
控制活動是內部控制成敗的關鍵所在,內部控制的環境再好,風險意識再強,如果沒有嚴密的控制活動,那麼也起不到內部控制應有的`作用。控制活動對組織目標實現的作用;控制活動執行的有效性;控制活動對風險的識別和規避。
（四）審查與評價資訊與溝通
資訊與溝通是銀行應對情況改變、保證控制有效的“神經系統”,關鍵是保證資訊真實與溝通及時。內部審計重點審查獲取財務資訊、非財務資訊的能力;資訊處理的及時性和適當性;資訊傳遞渠道的便捷與暢通;管理資訊系統的安全可靠性。
四、如何透過審計工作，具體推動銀行內控制度建設
（一）合理定位，建立內部審計的獨立性和權威性。由此，內部審計機構的設定應高於其他職能部門，有利於審計工作的獨立開展，樹立審計監督的權威，確保高質量高水平的銀行內部控制正常執行。
（二）配備高素質的內部審計人才。隨着內部審計由財務領域向經營、管理領域的拓展，審計機構在人員的構成上也應是多元化的，不僅要有懂財務的審計人才，而且還應配備精通銀行各相關業務的專門人才，選擇有豐富業務經驗的人員加入內部審計部門，使內部審計在銀行內部控制制度中發揮更大的作用。
（三）狠抓落實，強化內部控制執行的審計監督，使銀行內部控制監督達到事事有人負責，事事有人監督的要求。積極開展內控考覈評價，全面提升內控制度執行力。
（四）拓寬內部審計監控範圍，加強內部審計職能。堅持銀行經營管理活動的合法性、合規性、真實性審計與效益性審計相結合，全面推進銀行內控制度建設。