分公司的財務權力是管理資產，財務責任是實現利潤，實現利潤後根據薪酬制度兌現有關管理和生產人員的利益。總公司對分公司財務管理透過授權控制、預算管理、覈算、審計監督等方式，安排分公司的財務責權利體系。
一、授權控制
總公司對分公司在一定授權範圍內相對自主經營，在授權範圍以外的財務事項，則要報總公司批准，形成總分公司之間的授權控制制度。
1、授權管理資產
總公司對分公司資產管理的授權，是設立分公司而產生的授權，其對應的責任是保證資產的安全完整和良好使用，使資產保值增值，透過運營資產創造利潤。但此授權也不應是完全授權，分公司資產處置的權力應受到限制。
2、資金支出授權
對資金支出的授權。此授權依總分公司財務管理分權程度不同而不同。最大範圍的分權，是使分公司按照模擬法人的方式運做。在這種模式下，分公司可以擁有正常情況下完全的資金支出審批權。當然，在分公司非正常情況下使用的資金或者大額的資金，比如技術改造、大額合同、大額預算變動、資產處置等，則必須報請總公司審批支出。
對分公司資金支出最小範圍的分權，是使分公司按照車間的方式運做。這種模式下，分公司相當於總公司的一個大的車間，只是在生產和技術方面被充分授權，其資金支出審批權的範圍，只限於零星的小額支出。
對分公司資金支出的授權，使分公司擁有部分財務支配的能力，因此必須對分公司財務支出進行監控。常規的事前控制就是要分公司實行預算制度，使資金“算了再用”；總公司也可以據此瞭解各分公司預算資金盈缺狀況，在各分公司內合理調配資金，提高資金的使用效率。常規的事中和事後控制則依靠健全的會計覈算和控制制度。
二、預算管理
總公司授權分公司管理其資產，對應的責任是透過經營資產實現利潤，因此總公司於財年預算前要向分公司協調確定利潤目標，以量化規範總公司對分公司權責利安排；分公司應據此編定銷售、生產、成本、費用、採購等業務年度和各月預算，並把各業務預算分級歸口落實到車間、班組直至個人，形成有效的分公司內部各級責權利體系；分公司再依據各業務預算編定資金預算和預計報表等財務預算，總公司可以據此掌握各分公司預計資產負債和損益狀況，進行資金的預算平衡和合理調度。
預算管理體系運做的核心是責權利體系，所以必須要保證每一個層次責權利安排的有效。在分公司層面，是總公司檢查並考覈其年度經營目標，透過合理的人事和薪酬制度，激勵和約束分公司總體經營；在分公司車間層面，是分公司檢查並考覈其成本控制、費用支出、材料耗用、設備管理等日常財務目標，同時也要對車間層面制定和預算權責相匹配的'勞動人事制度和激勵、約束機制；依次向下，對於必要的預算控制項目，要落實到相關的個人。
三、覈算
對分公司應按照規定的會計制度，嚴格進行會計覈算和控制。總公司對分公司的會計覈算一般有兩種方式，一種是集中在總公司，一種是下放到分公司。集中的方式可以使總公司及時掌握所有財務資訊，便於總公司管理，但卻不利於調動分公司的積極性；相反，下放的方式具有較強的激勵作用，卻有礙於總公司瞭解詳細資訊，如果完全下放（即分公司自行設定財務部門和人員），還可能增加總公司的審計成本。所以，如果採取下放的方式覈算，則應由總公司向分公司委派財務會計人員，即會計業務下放，而會計人員集中。另外，良好的機財務系統的建立，將彌補下放覈算方式總公司不能充分了解會計資訊的不足。