一、事業單位財務會計內部控制的現狀
（一）事業單位的預算成本有盲目性
事業單位經過改革之後，在短時間裏面取得了一些成效，但是根本問題依然沒有得到有效解決。首先，事業單位的預算編制基礎比較薄弱，往往容易忽視項目具體細節，項目編制的需求是基於上一年度的收入和支出，並不注重預算年度內項目需要多少真實的資金投入，導致編制的預算與實際的需求脫節。其次，單位制定預算不夠嚴謹、不夠細化，缺乏科學性和可操作性，預算經常需要調整。此外，由於單位預算管理約束力不強，項目經費之間互相擠佔，隨意性大。
（二）事業單位的監督力度不夠
由於單位的領導對於內部監督在認識上存在誤區，認爲內部監督機構與單位是屬於對立的，領導往往存在牴觸情緒，因此阻礙了內部監督工作的開展。單位的內部監督機構隸屬於單位，屬內設機構，在人員編制、經費執行、獎懲激勵等方面沒有獨立性，導致監督工作不能做到客觀公正。其次，事業單位的內部監督機構中，很多人員是由其他崗位人員兼任或轉任的，人員老化、知識更新能力差等問題也是制約內部監督工作開展的一個重要因素。
二、加強事業單位財務會計內部控制的建議
（一）加強內部控制意識
內部控制的實現，重要的'前提和基礎是要增強內部控制意識，只有從思想上真正認識到內部控制的重要性，才能夠逐步完善事業單位內部控制。加強內部控制意識，首先是要加強事業單位領導的內部控制意識，單位領導負責對整個單位的財務會計工作負責，領導加強內控意識，能夠帶動單位內部全員對於內部控制的正確認知。其次是要加強財務會計人員對於內部控制的意識，使其熟悉國家的法律法規，在平時的工作中堅持原則，真正的做到按規章制度辦事，只有這樣才能夠保證內部控制有效的實施。另外，事業單位還應加強對內部控制的宣傳力度，讓全體員工瞭解內部控制的內容，掌握內部控制的流程，形成貫徹內部控制制度的合力。
（二）建立健全財務會計內部控制制度
1.建立科學的崗位設定製度事業單位應該根據單位的實際情況，建立科學的崗位制度，新增必要的崗位，合併或分流多餘的崗位，明確現有崗位的職責和權限，努力營造各崗位之間各司其職、既有分工合作又有互相制約的體制機制。
2.強化資金管理內部控制的重要內容之一就是資產管理，只有管理好單位的資金，才能夠保證單位的正常運營。事業單位一旦出現了資金上的漏洞，往往會帶來巨大的經濟損失。要強化資金管理，一是要結合單位自身的實際情況，制定出適用於本單位的資金管理制度，明確分工，將收入和支出等職責分散，加強單位內部的審計力度，對於任何超範圍、超標準使用資金的情況進行嚴肅處理；二是要保證資金的安全，確保不出現挪用公款、私設小金庫等現象。三是要嚴格控制單位的業務流程，在目前事業單位內部控制普遍不夠健全的現狀下，透過財務會計內部控制措施來規避不必要的風險；四是建立單位的內部監督機制，不定期的對崗位設定的合理性及員工的履職情況進行調查，確保內控制度的合法合規並得到有效的落實，確保資金使用能取得預期的績效。
（三）加強預算控制
預算控制包括預算的編制、執行和監督。事業單位應該細化預算的編制，特別是項目預算，在申報重大項目時應該委託中介進行可行性論證，以保證預算編制的質量及後續的項目的可行，避免資金的浪費。預算的執行中必須強調預算的剛性，確保資金能專款專用。透過內部審計、外部監督等形式，運用審計、檢查、績效評價等多種措施加強預算控制。
三、結語
事業單位的可持續發展離不開內部管理，而如何完善財務會計內部控制又是內部管理的重中之重，是事業單位迫切需要解決的一項工作，需要單位所有人員的共同努力，共同參與。事業單位制定並有效實施科學的、具有可行性的財務會計內部控制制度，是自身發展的需要，更是緊跟時代步伐，與時俱進，爲實現依法治國的重要保證。