大學生村官計劃的出發點是不容質疑的，但在實踐中遇到的一系列問題政府應加以考慮。
1.完善大學生村官的選拔和任用機制。
(1)完善的選拔體制。選拔要以"公平、公正、公開"的原則，要有合理化和科學化的選拔標準，不能帶有歧視性要求，並要保障選拔的有效性和合法性;透過嚴肅、嚴格的選拔程序，選出真才實學的優秀大學生到基層服務，以保證大學生的積極性和主動性。這需要注重很多細節：
(a)應挑選能吃苦、理解農村生活並且願意在新農村建設中實現自身價值的大學生;
(b)最好將大學生村官安排在自己家鄉，因爲他們瞭解家鄉人的思維習慣、民間風俗，思想感情上容易溝通，開展工作會更得心應手。
(2)加強選拔過程的透明度。向公民公開選拔流程、經過和結果，加強羣衆和媒體的監督。
2.解決大學生村官的身份問題。
(1)解決法律層面的身份問題。
(2)如果大學生村官在工作滿一定的期限後，仍然願意留在當地，繼續奉獻自己的才能，這就涉及到這樣一個問題：沒有當地的戶籍，能否參與村委會的改選。我認爲，應當對相關法律法規作一定的修改或補充，使得繼續願意留在當地服務的大學生有資格參加村委會的改選，給有熱情的大學生一個正當的名分。
3.加強對大學生村官任用的監督評價。
(1)分期評估，循序漸進。大學生融入到基層實踐工作是一個漸進的過程，應該在其工作的適應前期、成熟中期及其發展後期進行相應的效績評估監督。
(2)注重過程、成果的綜合考評。一套完備的評估體系不僅只是重視其計劃實施的結果，也包括在其具體工作過程中根據計劃實施中存在的缺點或錯誤，適時改進，不斷充實和完善。因此，"大學生村官計劃"在各地實行過程中，地方政府應根據各自實施的情況，對原有的政策措施作不斷的改進和完善。
(3)政策透明，羣衆監督。大學生村官的工作應從羣衆的根本利益爲出發點，接受人民羣衆的監督並積極傾聽和採納羣衆的建議和意見，堅持以羣衆的監督評估爲客觀標準，實現政策的透明化、公開化和科學化。
4.各級政府應爲大學生村官營造良好的成長環境。不能只讓大學生們停留在配角和附屬地位，要重視對他們的培養，使其成爲新農村建設的生力軍。
5.根本保障：健全管理機制。完善管理機制，建立起一套適合新時期大學生村幹部的管理機制，是保障他們發揮作用的重要一環。
6.保證大學生村官的參政、議政的權利。把大學生村官納入決策組織，是一種開放、民主的態度。大學生村官參與決策符合時代精神。
真正將大學生髮揮的作用落到具體的'崗位上，確定其參與決策的機會，參政、議政的權利。從國家長遠利益來說，他們只有在下面真正放開手腳幹，才能達到爲基層注入活力和新生，才能爲國家爲農村爲行政
體制改革，爲政府效能提高也爲他們自己的發展最終解決問題，這樣纔是整體效果和綜合效益的體現。
7.保證大學生村官職位的穩定。確保他們在掛職期間職位不會出現變更。
8.提供財政補貼。
國家財政應按照一定的比例提供相應的補貼，以解決好因大學生村官上任而帶來的地方財政問題。這一問題的順利解決，有利於帶動更多大學生去當村官的積極性。
大學生村官的待遇應和他們就業的機會成本相差不遠。否則，就可能不能形成對大學生村官有效的激勵。
9.建立和完善大學生村官培訓深造機制。爲使大學生村幹部儘快進入角色，政府應集中時間安排專人對大學生村官進行崗前培訓。採取與機關幹部結對子、召開座談會、實踐鍛鍊等方式，促進大學生村官社會經驗和工作才幹的提高。