一、“實質重於形式”原則貫穿於會計覈算的全過程
“實質重於形式”原則通常是上評判某一具體事項的標準，如稅務處理、註冊會計師審計等。但《企業會計制度》中的規定，僅對會計覈算而言。“企業應當按照交易或事項的實質進行會計覈算，而不應當僅僅按照它們的形式作爲會計覈算的依據”，在這裏按經濟實質進行會計覈算是唯一的，按法律形式進行會計覈算則不是唯一的。
一般認爲，會計覈算包括確認、計量、記錄和報告四個環節。在會計確認環節，應當根據經濟實質判定經濟業務事項是否應在會計主體中記錄、何時記錄以及記在什麼科目。例如企業購入非專利技術以及生產上的祕密訣竅，雖然未經公開註冊，在法律上得不到保護，但在實質上，由於它能給企業帶來超過正常利潤的效益，因而在購入時應該確認爲企業的無形資產，並進行會計覈算；又如融資租賃，儘管從法律形式上看，融資租賃資產所有權屬於出租方，但在一項不可取消的融資租賃關係中，融資租賃資產的大部分風險與報酬已轉移給承租方，承租方獲得由於使用該資產而產生的收益，因而應視同自有資產在承租方作資本化處理；再如，對企業收入的確認，不是以其銷售商品、提供勞務是否收取款項或取得收取款項的權利等形式來判定，而應以風險與報酬是否已轉移、管理和控制權是否保留、經濟利益是否能流入、收入和成本是否能夠可靠地計量等實質爲標準來判定。
在會計計量時，同樣應注重經濟實質而不是其法律或人爲形式來判定以什麼標準計量，記多少金額。如資產減值準備處理，首先要判斷資產價值是否可能減值以及減值的程度，若有證據表明資產的可變現淨值、市價或可收回金額低於成本，就說明資產已經受損或減值，爲了反映經濟真實，就應計提準備作減值處理；長期股權投資覈算有成本法和權益法之分，而成本法和權益法的劃分不僅要看其持股比例，更重要的應看其是控制、共同控制、重大還是無控制、無共同控制、無重大影響的實質；再如有的上市公司接受其他企業委託，實施對外股權投資，按照“實質重於形式”的原則，是否採用權益法及合併會計報表，均應按其本身實際投資比例以及對被投資單位的控制和影響程度加以確定。
在會計記錄和報告時，除了對己確認、計量的交易或事項進行記錄和報告以外，對或有事項的會計處理，世界各國及國際會計準則，一般在遵循“謹慎性”原則的同時也都遵循“實質重於形式”原則進行確認和披露。如對很可能發生且金額可以可靠估計的訴訟賠償，儘管在資產負債表日還沒有實際支出，但由於其很可能發生，有一定的內在必然性，就要預先列爲負債和費用（或損失），分別計入資產負債表和損益表中，並在會計報表附註中說明：對關聯方關係及其交易的披露，應視其關係的實質，而不僅僅是法律形式。通常情況下，不能由於企業與其他企業的.日常業務往來，或其相互之間的經濟依賴，或受某一企業和部門的影響而視爲關聯方，而主要應看在企業財務和經營決策中，對另一方是否有能力直接或間接控制、共同控制或對其施加重大影響，有能力者爲關聯方，無能力者則爲非關聯方，如果兩方或多方同受一方控制，則他們之間也存在關聯方關係；在合併會計報表編制時，是否納入合併範圍也應看其實質而不僅僅是以比例爲標準，這些都是“實質重於形式”原則在會計報告中的具體運用。
二、“實質重於形式”原則往往與其他覈算原則結合運用，起補充和修正作用
在十三項會計原則中，屬於起基礎性作用的是客觀性、相關性、可比性、一貫性、及時性、明晰性等原則，屬於確認和計量要求的是權責發生制、配比、成本、劃分收益性支出與資本性支出等原則，而謹慎性、重要性和實質重於形式原則往往是對上述原則起補充和修正作用。在會計實務中運用這些原則對交易或事項進行會計處理，往往是多項會計原則相輔相成作用的結果，而不應該是單一原則發揮單一作用。例如，在進行資產減值處理時，有些人認爲它僅僅是謹慎性原則的體現，實際上它是用實質重於形式原則和謹慎性原則對歷史成本原則的修正，以反映真實的資產價值和規避財務風險。在會計政策的選擇或變更時，同樣也是多種原則作用的結果。《國際會計準則l——會計政策的說明》中指出；“慎重、實質高於形式和重要性，應作爲選用會計政策的重要考慮”，其目的也是以反映經濟真實爲要。或有事項的處理，則是實質重於形式、謹慎性、重要性、客觀性（充分披露）原則的共同體現。實質重於形式原則要求當或有事項的實質與其法律形式不一致時，應當根據其經濟實質而不是根據法律形式來處理；謹慎性原則要求充分預計可能發生的費用和損失，不可預計可能發生的收益；重要性原則要求對重要程度不同事項進行區別對待和處理，一般可由其相對金額的大小和其發生概率來判定其重要程度；客觀性（充分披露）原則要求財務報表要充分披露影響資訊使用者決策的資訊，不能在報表內作爲具體項目確認反映的，要在會計報表附註中披露。