一、當前稅源管理存在的問題
問題一：稅源管理機構職能“缺位”。在新一論徵管改革中，隨着徵、管、查分離和計算機技術的廣泛運用，稅務專管員的職能發生了變化，由“管戶”爲主逐漸過渡到以“管事”爲主，這在一定程度上防止了“人情稅”和“關係稅”，有利於稅務系統的廉政建設，改革的方向是對的。但是，在一些地方也出現了“兩少一多”現象：稅收管理員下戶調查研究的少了，對納稅人的經營情況、繳稅情況及稅收結構進行認真分析的少了，依靠納稅戶自行申報來掌握稅源、指導徵收的多了。如申報不實，出了偷漏稅問題則由稽查部門去處理。這樣一來，在稅源的管理上便出現了“空檔”，管事與管戶在相當程度上脫了節。由於徵、管、查之間始終處於變動磨合的狀態，未達到統一和規範，稅源管理的職能存在“缺位”現象。辦稅大廳徵收人員不再下戶，就表徵稅，被動接受納稅人的申報資料，並不能主動收集納稅人的生產經營和稅源變動情況；基層分局（所）的稅收管理員對稅源控管乏力，由過去的專管員下廠瞭解企業生產經營情況變成了遠離企業、坐看報表的靜態管理，對轄區內的稅源底數不清，戶籍不明，造成大戶管不細、小戶漏管多，“疏於管理、責任淡化"的問題凸現。
問題二：稅源管理手段相對滯後。在當前稅源管理過程中，單一地以實現稅收的多少將納稅人劃分爲重點稅源和非重點稅源，工作重心側重於重點稅源的管理，在一定程度上忽視了非重點戶、非重點稅源、某些行業、某些區域及工作環節的管理，造成稅源管理“頭重腳輕”，徵管基礎薄弱，給一些蓄意偷逃稅犯罪分子以可乘之機。傳統的稅源管理手段相繼取消而喪失，而新的資訊管理手段又未到位，基層稅務幹部普遍感到茫然和無所適從。有的被動地等待資訊化建設的發展，寄希望於省局爲他們提供“一步到位”的辦法和手段。雖然近些年加大了資訊化的建設，實現了徵管業務流程微機管理，但目前稅源管理系統只能完成一些基本的統計工作，對稅源的狀況不能運用大量的資訊數據庫進行調研、分析和預測。此外，還建立沒有完全意義上的稅源監控網絡和管理監控機制，納稅人生產經營資訊傳遞渠道單一、滯後。
問題三：部門協調配合不得力。從外部來看，涉及稅源管理最緊密的工商、國稅、銀行、質監、土管、城建、地稅等部門之間的.協作配合還沒有真正建立起來，不能進行有效的資訊傳遞，更談不上資訊高度共享。從內部來看，徵、管、查三部門、機關科（股）室之間、上級局與下級局之間在強化稅源管理方面還存在工作脫節，協調配合不暢，沒有形成各部門齊抓共管、密切配合、協調一致的良性稅源管理機制，適應現代稅源管理的監控體系還沒有建立起來。
問題四：稅源管理力量有待進一步加強。在稅源管理過程中，困擾基層的一個主要問題就是徵管力量不足，城鄉稅源管理人力資源分配不合理，存在基層稅源少、人員多，而城區或重點稅源單位稅收任務重、人員少；機關管理人員多、一線稅源管理人員少等不合理現象。基層稅源管理人員應付事務性工作繁重，很難集中精力開展稅源控管，以致對納稅人的資訊掌握不全。同時存在部分地區稅收管理員制度落實不到位，稅收管理員日常工作存在任務不明、目標不清、考覈不到位的問題。稅收管理員業務水平參次不齊，適應現代稅收徵管的工作能力和稅收執法水平不高，工作缺乏主動，不能很好地履行工作職責。
問題五：經濟出現多元化，增加了稅源管理的難度。隨着我國市場經濟的發展和知識經濟與網絡時代的來臨，我國經濟與世界經濟深度接軌，各種所有制形式的經濟主體跨國家、跨地區、跨行業相互滲透，長期並存，使納稅主體呈現多元化；混合經濟、網上交易、資產重組等加劇，使徵稅對象呈現多元化；經濟主體經營活動的多樣性，使其收入來源也呈多元化，增加了納稅環節確認難度，稅源監管的複雜性與日俱增。而稅務機關對這些變化的應對措施相對滯後，使稅源管理工作陷於被動。