本碩士點是2005年經國務院學位委員會批准的碩士學位授權學科。有機化學是化學科學中的二級學科，直接應用於新物質、新材料和藥物合成等相關領域中，也與生命科學、環境科學、農業科學、地質科學和化學工程等專業緊密聯繫。本學科有機化學課程在94年晉升爲廣東省級優秀課程，廣州市重點課程;在90 年代多次獲得廣東省高等學校教學成果二等獎和廣州市教學成果一等獎。經過多年努力，不論在科研和教學方面均取得了較好的成績。近年來，有機化學學科與廣州化學藥創新中心的合作，形成了優勢互補的產學研緊密體系，更具特色。
近階段，廣州大學有機化學專業的多位指導教師承擔國家自然科學基金及省、市科研項目18項。科研經費258.5萬元，獲得廣東省科技進步獎一項，發表論文178篇，SCI收錄34篇，發明專利6項。廣州化學藥創新中心在研各類項目9項，總經費1820萬元，近年獲得省部、市級的多項科技進步獎。發明專利十多項。由此組建的有機化學碩士點，學科梯隊人員充實，年齡結構合理，學歷層次高，科研力量強，並形成了與本學科緊密結合、具有自己特色的、穩定的三個研究方向。