管理會計是二十世紀初產生的一門新興的會計分支學科，它把會計資訊應用於企業管理，爲經營決策優化和提高經營效率提供各種有用的方案和資料，從而幫助企業管理者做出正確的決策。目前管理會計在我國企業界特別是大中型企業中已經得到了較爲廣泛的推廣和應用，爲更多的決策者、理財人所掌握和利用，顯示出旺盛的生命力和廣闊的發展前景。目前，管理會計運用於高校的財務管理尚處於摸索階段，但管理會計在高校的應用必將對資源的優化配置、資金使用效率的提高以及財務管理的規範化起到促進的作用。
一、管理會計運用於高校財務管理的必要性
會計的職能是包括反映、監督和參與經營預測和決策。財務會計主要注重前兩個基本職能，而管理會計注重預測和決策。管理會計在經濟業務活動過程的主要目的有四個：一是預測，爲編制財務計劃提供依據；二是控制，在執行過程中進行覈算並跟蹤管理；三是決策，透過覈算結果對可選方案提出最優方案；四是評價，對實際業績進行考覈併爲下一會計期間積累資料。管理會計運用於會計的`一些方法，爲規劃、決策、控制與考覈提供資料資訊，爲決策者提供最終決策依據。管理會計偏重於爲單位內部管理服務。
目前，我國高等教育辦學機構、投資渠道、培養方式等教育體制狀況不一。但財務管理模式基本大同小異，大都採用高等學校會計制度進行覈算，很少爲學校的發展提供決策依據，未能行使管理會計的職能。面對各種不同的條件和對象，如何運用管理會計的內容進行規劃、預測、控制、評價是現今財務管理的一項主要目標。管理會計中獨特的預測方法，可以根據各種不同備選方案選出最優方案，進而可以爲高校投資發展決策，制定招生計劃及確定最低收費標準等提供決策依據。因此，高等學校在其經濟活動中充分運用管理會計這一手段，對其經濟活動加以反映、監督、預測和控制，從而提供決策的依據是十分必要的。
二、管理會計在高校財務管理中的運用分析
（一）投資決策的應用
目前，我國高校已經進入快速發展期，大多數高校需要擴大辦學規模，投資需求大。如何能使資金增值，避免財務風險，做到少花錢多辦事，實現低成本擴張，將是高校財務管理中的一個重要課題。高校可以運用管理會計中的貨幣時間價值和投資的風險價值兩個基礎概念進行決策分析。如果將資金存入銀行，可以獲得利息，幾乎沒有風險；如果將資金購買股票，可獲得高於銀行存款利息幾倍的報酬，但風險卻較大。高校財務管理可以運用概率分析的方法對風險和報酬做出科學的比較。以現金淨流量，內含報酬率爲評價指標，採用多元化投資策略，優化投資組合，形成一個財務風險相對分散而投資效益達到最大點的投資組合。管理會計中的投資決策方法將對高校財務管理工作有很大的幫助。
（二）預算管理的應用
管理會計的規劃控制職能主要是透過全面預算來實現，其中財務預算處於核心地位。目前，大部分單位在編制財務預算時，一般是以以前各種費用的實際支出數爲基礎，對預算期內的變化因素進行調整來確定。這種做法的一般缺點是將原來不合理的費用支出甚至錯誤決策帶來的不必要支出繼續存在下去，從而繼續造成浪費，既不符合真實性，也缺乏客觀性。特別是在高等學校由於實行收付實現制的會計原則，支出又不盡均衡，如一次高額購入大型實驗設備即作爲設備購置費一次列支，而不是以折舊形式計入成本（支出），以“以前實際支出數”爲基礎的不合理性顯而易見，或造成經費支出浪費、或造成經費安排不到位。零基預算就是以“零”爲基礎編制計劃和預算的方法，或者說，零基預算是寫在“白紙”上的預算。這種編制預算的方法不從原有的基礎出發，根本不考慮基期的費用支出水平，一切以“零”爲起點，從根本上來考慮各個費用項目的必要性及開支規模。具體到高校就是要根據年度或預算期的事業發展規劃以及教學計劃、科研計劃、購置計劃、維修計劃等，充分考慮支出的必要性以及價格質量等因素，按照有關的定額、標準進行編制。爲了發揮預算對支出的控制作用，預算的編制要力求明晰、詳盡，增強預算本身的可操作性和對支出規模支出過程的可控制性，做一件事清清楚楚、花一分錢明明白白，力戒“大概、可能、差不多，然而恐怕很難說”的模糊預算，起不到應有的控制作用，形同虛設，計劃要切實可行、預算要執行嚴格，同時要考慮執行中的變化因素，安排預算要留有餘地、以利於防範突發事件和確保資金週轉。同時還需要做好有關標準、定額資料的積累工作。