近年來國際和國內的熱門話題當屬電子商務及其相關應用，它已引起社會各界的廣泛關注。但電子商務的流動性、隱匿性及交易本身的數字化與稅務機關獲取資訊能力和稅收徵管水平不相適應，使之成爲優良的“國際避稅地”，給傳統稅收體制及稅收管理模式帶來了巨大沖擊和挑戰。
一、電子商務對稅收制度的挑戰
資訊革命在推進稅收徵管現代化，提高徵稅質量和效率的同時，也使傳統的稅收理論、稅收原則受到不同程度的衝擊。電子商務所具有的無國界性、超領土化以及網絡化、數字化等特點，使現行稅法落後於交易方式快速演進的步伐，主要表現在以下幾個方面：
(一)對現行稅制要素的挑戰
1．納稅主體不清晰。納稅主體是稅法的首要構成要素，在傳統貿易方式下，交易雙方誰是納稅人都很清楚。而網絡經濟超越了國家界限，交易迅速、直接．交易的主體具有虛擬性，使納稅主體國際化、邊緣化、複雜化和模糊化。
2．徵稅對象不明確。電子商務中許多產品或勞務是以數字化的形式透過電子傳遞來實現的，傳統的計稅依據在這裏已失去了基礎。由於數字化資訊具有易被複制或下載的特性，很難確認是商品收入所得、提供勞務所得還是特許權使用費，使得課稅對象的性質變得模糊不清。
3納稅環節將改變。網絡經濟貿易的一個特點是交易環節少、渠道多，這對流轉稅制中的多環節納稅產生挑戰。
(二)對現行稅收管轄權和國際避稅的挑戰
1．稅收管轄權難以界定。網絡貿易中，無法找到交易者的住所、有形財產和國籍，網址與所在地沒有必然的聯繫，因而處於虛擬空間中的網址並不能作爲地域管轄權的判定標準。
2．國際避稅問題加重。電子商務從根本上改變了企業進行商務活動的方式，商業流動性進一步加強，公司可以利用在免稅國或低稅國的站點輕易避稅。
(三)對現行稅收徵管的挑戰
1．稅務登記的變化，加大了稅收徵管的難度。現行的稅務登記是工商登記，但是資訊網絡的經營交易範圍是無限的。不需要事先經過工商部門的批准，從而加大了納稅人的確認難度。
2．發票的無紙化和加密技術的發展，使得稅收徵管工作受到制約。傳統商業活動徵稅是以審查賬冊憑證爲基礎，而網絡貿易中的賬冊和憑證是以網上數字資訊存在的，易修改和隱匿資料而不留任何痕跡。
3．代扣代繳的稅收方法受到影響。傳統的稅收徵管很大一部分是透過代扣代繳來進行的，由於交易雙方的隱蔽性和電子貨幣的出現，商業中介機構代扣代繳作用的弱化，將會對稅務部門的徵管工作帶來極大的不便。
二、應對挑戰的對策
(一)完善現行稅法，補充有關針對網絡貿易的稅收條款
1．對在線交易徵稅。確定有形動產的交易都要交納增值稅；對在線交易的服務歸結於營業稅範圍，計入服務業，按服務業徵稅；銷售無形資產和“特許權”的。按“轉讓無形資產”的稅目徵稅。
2．建立專門的電子商務稅務登記制度。即納稅人在辦理網上交易手續後，首先必須到主管稅務機關辦理電子商務的稅務登記，並提供網絡的相關材料；其次，稅務機關在對納稅人填報的有關事項嚴格審覈，逐一登記，併爲納稅人做好保密工作。
(二)完善稅收徵管工作
1．加強對“資金流”的管理。建立與銀行的固定聯繫制度，在各銀行間和稅務機關間的網絡建立接口，使稅務機關能對企業開設帳戶監控；要求商務網站提供所有會員的開戶銀行和賬號，在檢查加密材料的時候要配合稅務機關進行檢查；開具專用的電子發票．並經稅務機關對其真實性進行審覈，既保證了交易的安全性，又提高了稅務機關征收稅收的完整性。
2．實行電子申報方式。稅務機關要在互聯網上開設主頁。用專門的系統軟件，將規範的納稅申報表及其附表放在主頁中，納稅人可以下載並填寫納稅申報表，進行數字加密後，發送到數據交換中心進行審覈，同時將結果傳遞給銀行，由銀行從企業帳戶中劃撥，並向納稅人遞送稅款收繳憑證。完成電子申報。
(三)積極參與國際對話，加強稅收協調與合作