1．合理設定崗位，實行操作人員分級授權管理
，我們應根據會計電算化系統的業務要求，調整現有崗位設定，將現有的'財務負責人、主管會計、出納、稽覈等崗位，調整爲電算化主管、系統管理員、電腦操作員、系統維護員、電腦審覈、會計檔案管理員等。在崗位設定的同時，應建立崗位責任制，明確職責，責任到人。在分工時，應做到相互牽制、相互制約，從而防止出現舞弊和欺詐行爲。應將數據維護管理崗位與審覈崗位分設，系統操作崗位與系統檔案管理分設。另外，還應建立崗位輪換制。
對設定的各個崗位，我們還應建立權限控制制度，用密碼加以控制，防止非法操作和越權操作，防止財務機密外流，確保會計數據的安全、準確、可靠。密碼應由電算化主管統一管理。
2．嚴格上機管理制度
會計電算化系統下，會計資訊的安全尤爲重要。因爲儲存在機磁性媒介上的數據容易被篡改，有時甚至是不留痕跡的。目前，許多企業雖然有上機管理制度，但能嚴格執行的不多，大多數流於形式，這就給會計數據安全種下了隱患。爲了確保財務資訊的安全、完整和保密，我們應認真對待上機管理制度，填寫上機操作記錄，註明上機人員姓名、上機時間、上機操作、離機時間等。
3．會計數據的輸入控制
數據輸入的正確性和可靠性是保證會計資訊準確的首要環節，這個環節任何細小的錯誤都會導致整個會計資訊的不準確和失真。首先，應對進入系統的數據設定相應的審批制度；其次，應對較重要的數據設定各種密碼來控制輸入。如建立科目代碼與名稱參照；試算平衡控制，即每筆分錄和借貸方進行平衡檢查，防止輸入金額出錯；順序檢查法，即檢查記錄、憑證號碼有無遺漏或重複。
4．加強檔案管理
對電算化系統的有關資料應及時存檔，並對檔案定期進行備份。磁性介質數據應保持雙重備份。制訂檔案被破壞事件發生時的應急措施和恢復手段。
5．會計數據的輸出控制
，對會計數據的輸出大多未作設定，幾乎每個會計人員都可以打印輸出會計資料，而會計資料是一個的機密，任何疏漏都可能給企業帶來一定損失。爲此，我們應採取相應措施，規定輸出權限，對輸出的打印資料和磁性資料均要登記名稱、份數、日期、送達部門等，從而達到限制輸出資訊的目的。
對數據的輸出還應進行人工審覈，以確保輸出會計資料的可靠、正確，並經財務主管審批後方能報出。
6．提高軟件自身的控制功能
財務軟件應有防止重複操作、遺漏操作和錯誤操作的控制程序，並及時予以提示和制止。財務軟件的修改功能在方便使用的基礎上應加以限制，設定修改權限和修改痕跡控制。一是已複覈憑證若需要修改，必須首先取消複覈，然後修改，修改後再複覈方可記賬。二是對已記賬憑證，不允許恢復記賬，必須作衝賬憑證，保留修改痕跡。三是對已記賬的憑證和賬簿，不提供修復功能。四是財務報表必須按系統定義的格式和數據來源格式自動生成，系統不提供修復功能。