因個人檔案造成勞動者損失的問題，原來只能透過向上級部門投訴來協調。由於沒有上級主管單位的“新企業”越來越多，加上檔案涉及勞動者許多切身利益以及勞動者維權意識的提高，“檔案官司”開始出現了。這類由檔案引起的勞動糾紛由於性質特殊，勞動者要維護自己的合法權益比較困難。那麼，讀者如何才能維護自己的權利呢？
第一，不要讓檔案成爲“死檔”。要知道自己的.檔案保管在什麼地方，其中特別要注意是委託人才服務機構保管的，必須儲存好檔案保管的證明，及時繳納費用，不要讓自己的檔案成爲“死檔”。
第二，處分材料入檔須經本人認定。根據《流動人員檔案管理規定》，檔案中“收集的材料，必須經過認真的鑑別。需經單位蓋章或本人簽字的，簽字蓋章後方能歸入檔案”的規定，單位放入檔案的材料，特別是對勞動者處理、處分的材料要求經本人簽字認定。
第三，勞動關係解除及時轉移檔案。根據國家有關檔案轉移的規定，在解除勞動關係後，單位必須在一個月內將該員工的檔案轉移到所在的街道、新的工作單位。因此當我們結束了前一個工作時，應當關心自己的檔案是否及時轉移到位，防止在調換工作中檔案的丟失。
第四，檔案材料與事實不符，可要求單位認定並修改。如果發現單位在自己檔案裏塞進“黑貨”侵犯了自己的就業等合法權利時，必須注重蒐集足夠的證據，並透過法律維護自己的合法權益