與其他傳統行業相比，高科技行業的整體薪酬水平較高，這是不爭的事實。但隨着行業內部結構的調整和分工的進一步細化，薪酬的結構性落差也已經表現出來。北京外企太和企業管理顧問有限公司日前就2003年度IT類高科技企業的薪酬福利狀況進行了調查。調查將高科技行業細分爲五大領域，其中較具有可比性的四個領域爲互聯網、軟件及系統集成、電信、品牌電腦。調查數據顯示，四大領域薪酬的整體趨勢和水平是接近的。但將數據進行進一步對比，我們會發現，落差還是明顯存在的。首先是細分行業內職級間薪酬水平的差異。在電信行業，列入統計的最低級職位與最進階職位年度總薪酬迴歸值之比爲1∶8，而同樣的`比值互聯網行業爲1∶11.8，軟件及系統集成行業爲1∶15，品牌電腦行業爲1∶18.8。這種收入水平的差距還是十分明顯的。
形成這種差距的原因值得注意，僅從數據分析，軟件及系統集成行業的薪酬差距主要是由於進階管理層薪酬提高較快，而品牌電腦行業的薪酬差距主要是由於低層級職位的收入偏低。但更深層的原因是不同細分行業的人才結構存在差異。譬如，互聯網行業主要由技術、編輯、維護管理、製作等知識型人才支撐，而電腦行業則存在大量的有一定技術的藍領工人，他們的薪酬水平在整個行業裏還屬偏低的。
部門間的收入差距同樣值得關注，而且也更能反映行業內從業人員收入水平的不同。我們以品牌電腦行業爲例對各職能部門收入狀況作一簡單對比。得出的結論是，與生產環節密切相關的部門，各層級人員的收入水平都是偏低的，而銷售、市場及其相關的部門各層級人員的收入則相對較高。這種狀況的形成也並不難於理解。在電腦行業，生產環節的核心技術都是共享的，國內企業大都沒有自主的知識產權，因而對人員的技術性要求反而並不很高;相反，在銷售環節，由於市場競爭的加劇以及消費者對售後服務要求的提高，對銷售人員的專業素質和技術素質都有較高的要求。這一點必然反映在薪酬水平上。
總的來說，高科技行業無論在薪酬水平還是在薪酬結構方面，比其他行業都更能反映競爭性特點，因而一些落差的形成基本上是合理的，這一點也可以從本行業各層級的薪酬結構上得到證實。在高科技行業，一般員工的基本現金收入總額佔年度總薪酬的比重達72.8%，變動性收入只佔8.2%，體現了相當強的保障性特點。隨着層級的提高，變動性收入比重逐漸增大，在總監層達到了25%。這種薪酬結構的變化反映了現代企業績效管理的理念，也從另一個角度說明高科技行業的薪酬落差是市場選擇的結果。