善於設疑是教師教學藝術的主要表現之一。在生物教學中，教師應根據教學內容、教學目的和教學進程，精心設定一些富有啓發性的問題。透過巧妙設疑可以爲學生製造“憤”“悱”情境，激發學生探索求知的慾望與熱情，從而使學生集中注意力；可以開闊學生思路，啓發學生思維，使學生抓住學習重點和難點；可以發揮教師的主導作用，使師生的思路能協調一致，從而培養學生的思維能力。
一、在匯入中設疑
直接利用課題匯入設疑，可以使學生從開始上課就興奮起來，產生求知慾望和探求願望，促進學生積極思維。例如：在學習“物質的跨膜運輸的方式”一課時，先從前面學過的知識入手，透過提問細胞膜的選擇透過性及特點，在學生回答完這個問題後，然後提出問題：小分子物質及離子是如何透過細胞膜的呢？這樣來匯入新課，既可以承上啓下，又可以激發學生的求知慾，集中學生注意力。
二、在重點上設疑
教師在設疑時應根據教學目的，在重點和難點上設疑，而不能沒有目的性的處處設疑，這樣就會使問題太多，而缺乏思維深度。在重點與難點上尋找有代表性的問題，從而以點帶面。例如：在《減數分裂》教學中，在學習減數分裂過程時，我設計了這樣一個問題：減數分裂的第一次分裂和第二次分裂過程中染色體數目各有什麼變化？原因是什麼？透過對這兩個問題的思考，就抓住了染色體數目和行爲變化這個重點，讓學生帶着這個問題來學習減數分裂內容，就容易掌握這節課的重點知識了。
三、在比較上設疑
當兩種或多種相似或相反的對象同時出現時，可採用比較的方法設疑，讓學生在同中求異，在異中求同，從而使學生掌握其本質區別。透過比較思維可以培養學生抽象概括、掌握規律的能力。例如：在學習物質跨膜運輸的三種方式時，本人提出了這樣一個問題：如何區別這三種方式呢？從哪幾個方面比較呢？請大家設計出相應表格。透過這種比較使學生明確了三者異同，同時學會設計表格的方法。在比較時不僅要讓學生學會找出不同點，還要讓學生學習求同的方法，如自由擴散與協助擴散有什麼相同點？從而概括出被動運輸的概念。
四、在銜接上設疑
一個新知識既有它的階段性，又有它的系統性。爲了讓學生更好地學習新知識，我們應在新舊知識之間架起一座橋樑，以舊引新，自然過渡。這就要求教師在銜接處設疑，達到承上啓下的作用。例如：在學習過分離定律知識後，提出問題：如果同時考慮兩對相對性狀的雜交實驗會得到同樣的結果嗎？從而引導學生學習自由組合定律，並在隨後的學習中會應用到前面學過的分離定律的，好讓學生知道分離定律是自由組合定律的基礎。
五、在運用上設疑
當一個基礎知識或基本原理的教學之後，教師要善於設計一些應用性的問題或練習，使學生將所學的知識在生活或生產實際中加以應用，從而加深對基礎知識的理解，並且在應用知識過程中培養了學生的能力。例如：在學習物質跨膜運輸實例中的水分代謝知識後，我提出了這樣的問題：一次施肥過多會造成“燒苗”現象的原因是什麼？在學完光合作用和呼吸作用知識後，我設計了這樣問題：請根據所學的知識說出提高農作物產量的措施有哪些？原因是什麼？這些聯繫實際的問題既能使學生感興趣，又使所學的知識得到了應用，同時這種問題具有開放性，可以讓不同層次的學生都有思考的餘地，從而使不同層次的學生應用知識的能力都得到不同程度的提高。
六、在深化上設疑
學生的學習知識是由淺入深、由低級到進階，不斷深化的過程，教師應根據教學進程巧妙設疑，加速知識深化的過程，有助於學生加深對課本知識的理解。例如：在進行“探究植物細胞滲透作用吸水”學習時，就是透過質壁分離與復原實驗來證明的，在這個實驗完成後，我們提出了以下幾個問題讓學生深入討論：如果改用0.5g/mL的蔗糖溶液做實驗這個實驗結果會如何呢？如果用與0.3g/mL蔗糖等滲的KNO3溶液做這個實驗會出現什麼現象呢？這些問題與質壁分離實驗是密切相關的，並且是在質壁分離實驗的基礎上逐步深入。這可以讓學生獨立思考，也可以分小組進行，每個小組集中討論一個問題，然後小組代表闡述他們的觀點，其他小組可以提出問題，教師可以提出問題並作出必要的解釋，透過這種不斷深化問題的`思考，能夠讓學生思維的深度不斷增加，從而培養學生思維的深刻性。在學習基因的自由組合定律知識時，我設計了這樣一題：AaBb的個體自交後代中aabb的個體所佔比例是多少？AaBbCc的個體自交後代中AaBBcc的個體所佔比例是多少？這兩個問題逐步深入，需要掌握分離組合的方法才能快速解決。
七、在聯繫上設疑
各知識點是相對獨立的，但有些知識點之間有聯繫的，這種聯繫既有助於理解新知識，也容易引起混淆。這就要求教師在聯繫處設疑，這樣不僅能溝通知識間的聯繫，還可以引導學生辨別它們的聯繫和區別。例如：在學習減數分裂時，要利用有絲分裂的知識，也要注意兩者的區別。在講到精原細胞複製時，提問：複製的結果如何？這要求學生聯繫有絲分裂的複製思考。在講到第二次分裂時，要求學生聯繫有絲分裂的分裂期染色體行爲特徵，透過比較發現兩者的染色體行爲很相似，這是學生容易混淆的，這時提問：兩者有什麼區別呢？透過這種設疑，使學生能準確辨別它們的聯繫和區別。總之，在生物教學中設疑的方式有多種，這要求我們在教學中不斷總結，靈活應用，使學生在解決問題的過程中學習新知識，激發學生的學習積極性，以達到提高課堂教學效率的目的。