當前位置:學問君>學習教育>畢業論文>

生命科學圖像採集系統論文

學問君 人氣:5.55K

1共焦顯微原理與系統方案

生命科學圖像採集系統論文

基於針孔式掃描盤建立的快速共焦顯微系統的結構如圖1所示,激發光源發出的光經過準直、擴束之後,透過分光鏡,依次經過快速掃描盤和顯微物鏡。物鏡匯聚的激發光照射在樣品上,樣品受激發射的熒光按照原光路返回,當發射熒光經過快速掃描系統時,被濾去物方非焦面發射的雜散光。分光鏡反射的熒光經過透鏡匯聚後被CCD接收,獲取樣品共焦顯微圖像。透過控制樣品在Z軸上步進,進而改變樣品的光切位置,可以獲得樣品不同切面的圖像,最終透過一定的圖像處理技術可以獲得樣品的三維圖像。

2EMCCD相機結構與組件內容

圖1所建立的共焦顯微系統以針孔盤作爲掃描部件,它以多點針孔同時對視場進行掃描,因此,圖像採集器件宜採用面陣器件,綜合探測靈敏度、圖像輸出幀頻、空間應用等角度考慮,系統採用EMCCD作爲圖像採集器件。它與傳統CCD器件在感光、存儲等結構上並無差異,之所以在探測靈敏度、信噪比上表現出色,是因爲在其讀出寄存器之後又多出了一串增益寄存器,增益寄存器的單個倍增單元如圖2所示。與普通的三相CCD轉移電極相比,EMCCD將Ф2分爲Ф2和Фdc,一般Фdc接2V左右的直流偏置,Ф2接高壓(40V左右)轉移時鐘,由於Ф2與Фdc之間存在高壓差,當信號電荷從Ф1向Ф2轉移時,強電場會使電荷加速並與其他電荷碰撞產生新的電子,電子被Ф2勢井收集實現1次信號倍增。單個倍增單元的倍增率是隨機的,一般在1%~1.5%範圍內,雖然單個倍增單元增益很低,但當多個倍增單元級聯時,總增益由式(1)確定G=(1+g)n.(1)其中,g爲單個倍增單元的倍增率,n爲倍增單元數,當n取500時,總增益可能達2000倍以上。系統採用英國E2V公司的`CCD97器件作爲成像探測器[3],CCD97是減薄背照式幀轉移型EMCCD,具有512×512有效像素,像素尺寸爲16μm×16μm,它同時具有普通模式與倍增模式成像方式,相應具有兩路讀出放大器。倍增模式下製冷到-40℃,可達30photons/pixel/s(積分時間爲0.1s)的探測能力,滿足弱光探測需求,同時在11MHz像素時鐘下,噪聲低於1電子/pixel,量子效率達90%以上,滿足高幀頻需求。整套系統的電子學設計圍繞EMCCD的驅動需求展開,按功能主要劃分爲3個模組:邏輯驅動模組、功率驅動模組和上位機圖像採集模組,系統功能框圖如圖3所示。

2.1邏輯驅動模組

邏輯驅動模組主要完成EMCCD幀轉移、行轉移、行輸出等邏輯信號輸出、AD時序控制輸出、SRAM時序控制輸出以及圖像數據串行輸出等功能,邏輯模組核心器件採用ACTEL公司的APA300器件,它基於Flash技術,無需配置芯片,功耗低,對固件錯誤有較好的免疫作用,可以抵禦一些高能粒子的衝擊,最大優勢在於在特殊環境下可以穩定可靠地工作,適合航天領域的應用。圖像信號採集部分用AD9824,它是ADI公司一種專用於CCD信號處理的AD器件,它包含14位精度最高採樣率爲30MSPS的A/D轉換器,芯片內部集成了相關雙採樣電路、像素增益放大器、可編程增益放大器。邏輯驅動模組的硬件程序各子模組的調用關係如圖4所示。

2.2功率驅動模組

CCD97的驅動除了對信號相位要求嚴格外,還要求信號電平和上升時間多樣化,針對不同信號的電平和上升時間需求,功率驅動模組採用4種電路方案,包括偏置電平電路、圖像轉移信號電路(ФIS,ФR)及高壓時鐘電路。由於CCD97直流偏置所需電流不大,所以,偏置電平電路採用電阻分壓與運放跟隨實現。圖像轉移信號上升時間較短,需要較大的驅動電流,圖像幀轉移、行轉移、行輸出信號功率驅動電路以EL7457作爲核心器件。它是Elantec公司推出的四通道CMOS專用驅動器,最高工作頻率可達40MHz,最大驅動電流2A,具有低輸出阻抗、外圍電路簡單、方便電源管理等優點,非常適用於多電平復雜時序的CCD器件驅動設計。圖像轉移信號功率驅動電路如圖5所示[4],由於ФI,s,ФR信號的上升時間要求不同,實際調試電路時選擇合適的電阻器(R1~R5)使得信號上升時間儘量滿足器件需求,保證輸出的圖像質量較高。高壓時鐘是實現倍增模式成像的關鍵信號,它的電平決定了倍增增益,並最終影響器件在低照度下的成像效果。由於高壓時鐘的電平較高,一般在40V左右,驅動電流100mA左右,使用集成元件很難實現,所以,高壓時鐘電路採用分立元件實現,電路如圖6所示[5]。圖中電路的靜態偏置由二極管D1,D2,D3,D4,D5,D6以及電阻器R1,R3,R4所組成的分壓網絡提供。Q1的柵源極靜態電壓約爲-1V,Q2的柵源極靜態電壓約爲1V。當FPGA驅動脈衝爲低時,U1和U2的輸出爲5V,Q1的柵源極電壓爲-1V,Q2的柵源極電壓爲6V,此時,Q1關斷,Q2導通,2HV被拉低到0V;當FPGA脈衝爲高時,U1和U2的輸出爲0V,Q1的Vgs爲-6V,Q2的Vgs爲1V,此時Q2關斷,Q1導通,Ф2HV被拉高到電源電壓Vhigh。Ф2HV的輸出相位與FPGA輸出邏輯信號相同,高低電平與高壓電源一致。

2.3上位機軟件

上位機控制軟件主要負責指令編碼、指令下傳以及圖像數據接收、圖像數據存儲、圖像顯示等工作。上位機軟件開發環境爲VC++6.0,透過調用操作系統自帶的MScomm控件完成指令下傳與數據接收。透過點擊介面上的“開啟串口”按鈕建立相機與上位機間的通信,點擊“開啟相機”按鈕完成相機參數與開機指令下傳,開啓圖像數據接收線程,待正確接收數據包頭並完成一整幅圖像數據接收後,顯示接收圖像並儲存圖像數據。

3圖像採集驗證與分析

驗證實驗鏡頭採用MV2514機器視覺鏡頭,該鏡頭放大倍率爲0.23倍,焦距爲25mm,F數可小至1.4,可見光波段內透過率約90%,機械接口爲標準C接口,可相容2/3inCCD,最小工作距130mm。實驗中採用6mm特寫環在0.01lx微光、100ms積分時間、2dB增益條件下使用普通模式與倍增模式分別對同一目標成像,圖像如圖7所示。從獲得的暗背景條件下的圖像數據可計算出噪聲平均灰度值與方差,分別選擇普通模式下與倍增模式下目標圖像的最亮點作爲信號,取多幅圖像數據的亮點信號並計算平均值,可以獲得普通模式下與倍增模式下的信噪比,列於從表中可以得出:相比普通模式,在44V倍增時鐘電壓驅動下,倍增模式輸出圖像的信號有7倍提升,信噪比也有8倍提升,證明CCD97在微弱光條件下,使用倍增模式可以獲得較高質量的目標圖像。根據圖1搭建共焦顯微系統,使用40倍物鏡對擬南芥進行熒光顯微成像。普通顯微模式與共焦顯微模式分別對樣品所成圖像如圖8所示。EMCCD相機倍增模式與普通模式使用相同AD增益,積分時間分別取100,50ms。從圖8可以看出:EMCCD在倍增模式下可以獲得比較清晰的擬南芥葉肉共焦顯微熒光圖像。相比普通顯微模式,由於對樣品進行光切的原因,使得系統在共焦顯微模式下可以清晰的分辨出擬南芥葉肉葉綠體。

4結論

透過對空間生命科學實驗中共焦顯微的原理分析,提出一套適用於活體目標觀察、對樣品低損傷的共焦顯微方案。根據目標的掃描方案和獲取目標發射光的能量大小提出基於CCD97的弱光圖像採集系統,將系統分成3個功能模組分別實現並最終完成原理樣機研製。在普通模式與倍增模式下分別獲取目標圖像,從圖像效果可以看出:該成像系統性能較高,對弱光目標有很好的成像效果,且該系統具有體積小、可靠性高、適合空間應用等特性。