爲了深刻理解和正確運用基本理論，要注意下列各點：
首先，與論題有關的經典著作和重要文章要做到讀懂讀通。畢業論文作者要選定與論題密切有關的經典著作和重要文章，加以反覆閱讀，邊讀邊想，直到讀懂、想通與論題有關的理論問題，切忌一知半解或片面的理解。爲了加深理解，最好的辦法是做讀書筆記，把與論題有關的理論要點、警句摘錄下來，有了體會還可寫讀書心得，如果是自己的書或報刊、雜誌則可以作眉批，或把疑點、難點作出標記注在上面，以備日後進一步研究。
其次，要科學地掌握理論，必須善於聯繫。一是聯繫理論所形成的客觀條件，這樣可以幫助我們更確切地理解這一理論的內容。比如，要撰寫《關於培育和完善建築勞動力市場的思考》，就必須把市場形成的前提條件聯繫起來考慮，掌握了市場形成的一般前提條件，自然而然也就引申出建築勞動力市場形成的前提條件：其一，體制條件;第二，相關市場條件3其三，行業用工特殊性條件。二是聯繫與其相關的理論，這可以幫助我們進一步把握這一理論的實質。仍以上文爲例，要揭示建築勞動力市場產生的客觀必然性，不僅要掌握社會主義市場經濟理論，還應掌握與此相關的理論，譬如哲學原理，馬克思主義的唯物辯證法認爲，事物是普遍聯繫的，一事物的產生總是它事物作用的結果，從這一原理我們認識到，建築勞動力市場之所以能在當代中國應運而生，也存在着孕育它產生的.必然的前提條件，這推動着我們去探究促使建築勞動力市場產生的“他事物”。
最後，必須在理論指導下進行創造性的思考。撰寫畢業論文必須有理論的指導，但是，理論並不能爲人們提供解決問題的現成答案。因此，閱讀經典著作和重要文章，決不能只是消極被動地接受其中的某些結論，而要創造牲地思考，努力從前人的知識中尋求某些啓發，用以指導自己探索當前面臨的問題。對於前人提出的結論中那些已經不適合現實情況部分，要敢於提出疑問，敢於提出新的看法，這並不像有人所認爲的是“高不可攀”，只要我們刻苦鑽研和思考問題，把所學到的前人論述一一用實踐去檢驗它，把它一分爲二，孰是孰非，把正確的錯誤的區分開來，分別排隊研究，就自然會產生自己的見解，對前人的觀點作出補充、發揮、糾正、批駁，就自然會形成自己的新觀點，產生自己的畢業論文。歷史學家張蔭麟還在上清華中學時，就去大學旁聽梁啓超講課，聽後有不同意見，寫了一篇反駁文章，文章質量很高，在雜誌上刊登後，編輯以爲是教授寫的，將稿費寄到清華教授宿舍。梁啓超十分欣賞他的才華，便精心培養他，結果，張蔭腸二十幾歲就成爲一位歷史學教授。一個十幾歲的中學生能做到的，我們二十幾歲的大學生，三四十歲的成人高校學生透過努力，爲什麼就做不到呢?更何況社會在不斷地發展，前人提出的理論中那些沒有涉及的問題必然會越來越多，我們要勇於思索，勇於開拓新的領域。