創業公司分配股權的方式比較單一，通常來講是2種方式。一是按照股東的出資比例進行分配，二是在股東之間平均分配。2種方式都有自己的短板，第一種往往造成股東的貢獻和持股分配不均衡的問題，第二種則容易造成削弱核心創始人對公司的控制力，影響公司的決策效率。
所以，創業公司應該如何分配股權，才能避免以上的問題？泰山管理學院認爲，解決以下幾點問題，則能達到股權激勵最好的效果。
股權分配的三大原則。
創業如逆水行舟，只有同行者目的明確、方向一致、公平和激勵並存才能成就長遠、穩定的關係。股權分配就是這麼一個落實到“人”的過程，它的目的不僅要透過“醜話說在前頭”來確立規則，還要明確公司基因和價值觀、達成股東間的共識。
鑑於創業公司初期股東和管理層通常是重疊的，暫無須考慮股東與管理層之間的博弈，筆者認爲確立股權分配時需要考慮三個因素，分別是：股東於資源層面的貢獻、股東於公司治理層面的把控以及公司未來的融資造血空間，當然上述三個因素仍有分解的空間，比如資源就可以按出資、投入時間細化，出資又可以按照是貨幣、實物、知識產權等對公司的價值進一步細化。
選擇實繳註冊資本比認繳註冊資本好。
除非法律、行政法規以及國務院決定另有規定外，公司的註冊資本不必經驗資程序，由全體股東承諾認繳即可，認繳期限由股東自行約定，但是，這不意味着股東可以“只認不繳”，也不是說註冊資本越高越好。
認繳制下股東的出資義務只是暫緩繳納，股東仍要以認繳的出資額爲限爲公司的債務承擔責任，若股東爲了顯示公司實力，不切實際的認繳高額註冊資本，那麼將面臨多重法律風險，例如當債權人向公司索償時，股東的清償責任也隨之加重，又如公司解散時，股東尚未繳納的出資將作爲清算財產，另外也需要考慮稅務風險。
以公司治理結構保障核心創始人的控制權。
1、在無特別約定時，股東會作出的一般決議需要股東所持表決權的'半數透過，股東會作出的特別決議如修改公司章程、增加或者減少註冊資本的決議，公司合併、分立、解散或者變更公司形式等，需要股東所持表決權的三分之二透過；
2、表決權與股權比例掛鉤，“但是，公司章程另有規定的除外。”
結合實際情況，創業公司往往有多個創始人，加之股權衆籌大行其道，核心創始人的持股有可能達不到絕對控股比例。
股權分配方案要最終落地於工商登記。
出資是股權分配的必要依據，卻非唯一依據，創業者最終覈算的股權分配方案往往與出資比例不一致，有些創業者會採用陰陽協議的方式，一方面簽署投資協議固定真實的股權比例，另一方面按照出資比例完成工商登記。
但是，上述方式的法律風險很大，一旦涉訴，不僅創業者的股東權益難以獲得保護，亦會消耗大量的時間成本，導致公司錯失成長良機。在此情形下，可考慮採股本溢價方式解決：首先，創業者之前簽署投資協議，明確每位創業者的實際出資和股權比例；繼而，由創業者按照確認的股權比例和換算後的出資額進行工商登記，把股東超出登記出資額的部分計入資本公積金。
用好有限責任公司的股權回購條款。
對創業公司來說，股東之間的志同道合尤爲重要，因此股權分配需要從正向和反向兩個維度進行考慮。即既要從正向保障創業者同船共濟時的公平和激勵問題，也要從反向考慮某些特殊情形下如創業者離職退出、離婚、繼承等情形下公司股權的回收問題。
回購制度是平衡股東退出和公司利益的重要制度途徑，但是公司法對有限責任公司的股份回購是有限制性規定的，因此在設計回購條款時，應注意幾個問題，一是回購條款最好由公司指定的其他股東實施，且應注意回購定價的公平性；二是回購條款的適用範圍能夠涵蓋公司股權分配的反向所需；三是應將回購條款和股權轉讓制度綜合考慮、糅合設計。
期權池還是由核心創始人代持的好。
對創業公司來說，預留期權池不是新鮮話題。不少創業者沒有重視期權池的問題，要麼在期權制度尚未建立的前提下早早送出，反而引發了不少爭議，要麼造成了核心股東持股的不必要稀釋。
1、期權本質上來源於現有股東所持股份，但若由各股東按比例分散持有，未來恐難以統一運作，易引發爭議並影響實施效率；
2、有限責任公司體制下期權激勵方式相當靈活，採用何種定位和方案取決於公司的現實選擇，應在公司配套的期權制度建立後具體實施；
期權池確應早作安排，方法是在擬議股權分配方案時，就從各股東處劃分出來，由核心創始人一併代持，其他股東可透過協議明確代持權利的性質和處置限制。
創新運用公司法的各項制度。
公司法的自治空間是相當寬廣的，創業者要充分運用股東的章程自治權，建立適合自己的股權分配和動態調整方案。
比如有些股東願意“掏大錢、佔小股”，那麼對此類股東可以配合使用協議和章程方式將分紅權、優先認購權、表決權脫鉤，設計符合各股東需求和長處的股權結構；再如可以借鑑資本工具的思路，運用可轉換優先股、清算優先權等思路做股權分配設計。
創業公司的股權分配本質上並不複雜，但創業者確實應該給予相當的重視。若能在前期花費少量時間把相關問題理順，是能起到事半功倍的效果，助力公司的良性發展。