全市中醫藥工作總的指導思想是：以“三個代表”重要思想爲指導，認真貫徹落實《中華人民共和國中醫藥條例》和《省發展中醫條例》，注重發揮中醫藥特色和優勢，堅持在繼承中創新，堅持“人才興業”、“科教興醫”戰略，大力加強中醫藥人才培養；加強中醫機構建設，繼續開展醫院管理年活動；加大中醫醫療機構專項整治力度；強化基層中醫工作，完善農村三級中醫藥服務網絡建設；進一步發揮中醫藥在突發公共衛生事件防控、重大疾病防治以及農村衛生、社區衛生工作中的作用；努力開創我市中醫工作新局面。
一、加快中醫藥應對突發公共衛生事件能力建設，積極參與突發公共衛生事件防控、重大疾病防治。
將中醫藥納入公共衛生體系建設，加強中醫醫院感染性疾病科建設和急診科建設，組織開展中醫藥應對突發公共衛生事件業務知識培訓，提高隊伍素質，提高應對突發公共衛生事件能力，充分發揮中醫藥在重大疾病防治以及農村衛生、社區衛生中的作用，積極參與人感染高致病性禽流感及艾滋病的防治工作。
二、加強醫院管理，提高中醫醫院服務能力。
按省中醫藥管理局“中醫特色年”要求，在各級中醫醫院繼續開展“醫院管理年”活動，認真落實《中醫醫院管理評價指南》，加強中醫醫院內涵建設，突出中醫特色的辦院方向。依據《省中醫醫院管理評價指南實施細則及評價考覈評分辦法》和《省中醫醫院中醫特色考評辦法》，加強對全市中醫醫院督導檢查和綜合評價，命名錶彰“市示範中醫院”，爭創“省示範中醫院”。對忽視中醫特色的中醫院給予“黃牌警告”。
鞏固“二甲”中醫醫院等級評審成果，提高醫院科學管理水平。對未上等級縣（市）中醫院，要加大督導力度，年內力爭要有1-2所醫院達到“二甲”標準。
繼續落實衛生部等七部委“打擊非法行醫專項整治方案”、“市打擊非法行醫專項整治方案”，結合我市中醫醫療市場的現狀，開展打擊非法行醫專項行動，進一步加強中醫醫療市場監管，重點對虛假醫療廣告、聘用非衛生技術人員、擅自擴大診療科目、對外承包科室進行嚴厲查處，營造良好的中醫醫療市場環境。整頓和規範中醫醫療性保健按摩、中醫美容市場。
三、強力推進專科建設，努力形成學科優勢。
進一步加強重點中醫專科（專病）建設，做好重點專科發展規劃，加強中醫優勢病種研究，優化診療方案，探索單病種管理規範，提高醫療質量，降低醫療費用。扶持發展勢頭好、中醫特色濃的省級重點專科，打造中醫品牌。
四、積極開展“農民健康保健工程”和中醫藥進社區工作。
認真貫徹衛生部、國家中醫藥管理局《關於在新型農村合作醫療試點工作中充分發揮中醫藥作用的意見》，認真落實“萬名醫師支援農村衛生工程”，增強對口支援的實效。結合中醫工作先進縣建設、中醫藥進社區、農村，萬名醫生志願支援農村，多種形式開展便民、惠民活動，在縣級以上中醫院按5%的牀位比例開設惠民病房，開展“流動醫院”下鄉活動，充分發揮中醫藥的特色和優勢，紮紮實實開展好“農民健康保健工程”。認真研究並逐步解決農民“看病難，看病貴”的問題。
推廣新市區全國中醫示範社區創建工作經驗，深入開展“省級社區衛生服務中醫藥特色示範區”創建工作，積極探索中醫藥融入社區衛生服務的途徑和方法，不斷豐富中醫藥服務項目，強化中醫藥服務功能，推廣中醫藥適宜技術，爲廣大社區居民提供簡、便、驗、廉的'中醫藥服務。
五、完善中醫藥服務網絡，整體推進農村中醫藥工作。
以建設農村中醫工作先進縣（市）爲載體，縣抓中醫院、鄉抓中醫科、村抓中西結合方法，積極推廣實用技術。認真按照《新型農村合作醫療試點工作充分發揮中醫藥作用的指導意見》、《省農村初級衛生保健發展規劃》中醫藥工作指標要求，保證鄉、村衛生組織中醫藥人員比例和中醫藥業務開展。結合落實《鄉鎮衛生院中醫藥服務管理基本規範》，完善鄉鎮衛生院中醫科功能，提高中醫藥服務水平。
加強農村衛生室建設，做到人員、房屋、設備、管理四配套。使80%鄉村醫生能中會西、能西會中以及採用中醫藥適宜技術開展中醫藥服務，用簡、便、效、廉的方法爲人民羣衆防病治病。
繼續深入開展農村中醫工作先進縣建設，制定創建農村中醫工作先進縣規劃。各地要按照省農村中醫工作先進縣標準積極創造條件，列出計劃，全力爭創。年內在、等縣開展省級農村中醫工作先進縣創建工作，年底力爭達標。，開展“全國農村中醫工作先進縣”創建工作，按照國家有關標準，加強人才培養、制度建設等基礎性工作。爭取早日透過國家驗收。
六、加強人才培養，提高隊伍整體素質
按省中醫藥管理局的要求，成立中醫藥繼續教育辦公室，啓動“杏林311工程”。大力培養中醫藥合格人才。以不斷滿足人民羣衆日益增長的對中醫藥醫療保健服務的需求。
做好中醫住院醫師規範化培訓，加強中醫藥繼續教育基地建設,促進工作制度化、規範化。
實施“優秀中醫臨牀人才培養項目”和“3515項目”，抓住“讀經典、做臨牀、拜名師”三個關鍵環節，培養進階中醫臨牀型人才。
深入開展中醫藥師承教育，做好全國第三批和省級第二批師承的結業出師考覈工作。
加強管理人才培養，透過舉辦中醫院院長培訓班等形式，建立一支懂經營、善管理的醫院管理人才隊伍，努力提高全市中醫醫院管理水平。
開展中醫藥重點學科建設工作，積極創建省級、國家級重點學科，培養學科帶頭人。
進一步加強農村中醫藥隊伍建設，重點加強鄉村兩級衛生技術人員中醫藥知識與技能培訓。繼續實施鄉鎮衛生院中醫臨牀技術骨幹培訓項目和鄉村醫生學歷教育項目，努力提高農村中醫藥隊伍的學歷層次和技術水平。做好中醫藥適宜技術推廣工工作。
七、注重繼承創新，提高中醫藥自主創新能力。
加強中醫藥科研實驗室規範化建設，加強對中醫藥科研課題的在研項目管理，保證研究工作按計劃實施。精心組織省中醫藥管理局科技專項和省科技計劃課題的申報，繼續開展科研培訓，提高中醫藥隊伍的科技水平和自主創新能力。縣級以上中醫院要制定科研計劃，年內力爭市級以上科研立項30項，科研成果不少於10項。各單位要設立科研專項獎金，鼓勵中醫藥人員開展中醫藥臨牀科研工作。
八、進一步做好中醫藥資訊和新聞宣傳工作
建立全市中醫藥資訊網絡，強化中醫藥行業資訊宣傳意識，培訓中醫藥行業資訊宣傳專兼職人員。做好媒體宣傳和輿論引導工作，宣傳黨的中醫藥政策，宣傳中醫藥的科學性以及在保障人民羣衆健康方面的地位、作用和優勢。
九、加強學會工作
宣傳國家政策。組織重點課題研究，開展學術交流，成立相關專業委員會，挖掘和整理祖國醫學寶貴遺產，走“學會辦實體，實體養學會，學會促中醫事業發展”之路。爲我市中醫事業發展做出貢獻。