1發酵過程中的化學工程問題
1.1動力學與放大問題
乙醇發酵過程前期主要的活動內容是乙醇原料的液化、糖化等，在初期階段結束以後進入到乙醇的應用特性控制階段。這一階段解決的主要問題是其發酵反應的動力學問題，也就是發酵反應能否繼續下去的關鍵問題，主要包括有兩個層次，一是本徵動力學，主要是指從一種物質形式的本質屬性出發對發酵生物反應固有速率的研究；二是宏觀動力學，主要是從乙醇製備的反應器整體角度出發，充分考慮反應器中原料物質之間的能量傳遞情況的動力學研究。其中酶催化反應是應用最廣泛的一種動力學模型。
1.2發酵罐多場問題
在具體的乙醇發酵過程中發酵罐是發酵功能實現的主要設備，而乙醇的發酵過程是一個複雜的過程，發酵過程中受各種因素的影響，溫度、濃度等各種反應特性的傳遞會受到限制，從而在罐內形成不同的反應場，這種不規則分佈的反應場會對反應的正常進行產生影響，例如對氧在發酵液中的傳遞速度、固定化酶傳播等反應應有的過程產生影響，進而影響發酵反應的質量。但是正是發酵罐中的這種多場現象，爲研究人員提供了干預發酵罐中發酵反應的契機，透過對反應罐中多場化現象的研究和有效利用，可以實現對乙醇發酵過程的人工干預，爲乙醇質量的提升奠定了基礎。
2提純過程中的化學工程問題
使用發酵方法制作乙醇製得的發酵液中，乙醇的含量較低，通常情況下只有5%到12%之間，這種濃度的乙醇是無法用作燃料的，所以在乙醇發酵工作完成後對乙醇溶液進行提純是一個必要的環節。當前應用最廣泛的乙醇提純技術是蒸餾技術，透過精蒸餾的方法將乙醇中的水分有效排出，通常情況下使用這種提純技術只能將乙醇的含量提升到90%左右，在這種純度基礎上再使用蒸餾技術進行提純，其提純效率已經極低。所以爲了保證乙醇溶液實現有效的工業應用，應該使用綜合提純方法對其進行提純，提純活動中首先以精蒸技術對乙醇溶液進行粗提純，在提純形成的90%乙醇溶液基礎上再應用萃取、共沸和吸附等精提純工藝做進一步提純，形成工業應用需求的相應濃度乙醇產品。
3生物發酵反應與分離過程的耦合
從乙醇發酵工藝角度來看，現代乙醇製作工藝研究的內容還是一些基礎性的內容，涉及到乙醇製作的具體工藝步驟，而生物發酵反應與分離的耦合並不是一種單純的乙醇發酵製作工藝的完善，而是從乙醇製造整體角度出發對乙醇製造過程中的能量傳遞和化學反應的優化。從當前的乙醇製備角度來看乙醇製造存在着一個乙醇分離和提純的過程，這兩個過程的.分離導致了整個製備過程製備資源和能量的浪費，如果能夠將乙醇的分離過程和提純過程結合在一起，也就是說提升發酵分離過程產生的乙醇溶液濃度，就能夠減少乙醇提純過程的負擔，甚至可以實現化學反應結束以後直接製得符合濃度要求乙醇的目標。這種生物發酵反應與分離過程的耦合極大的提升了乙醇製備的效率，是乙醇製備工藝發展的未來技術。
4結語
燃料乙醇是當前實用性崔強的清潔能源技術形式，其製備工藝的發展對我國能源危機的化解、能源結構的優化具有鮮明的現實意義。本文從發酵過程中的化學工程問題、提純過程中的化學工程問題和生物發酵反應與分離過程的耦合三個角度對這一問題進行了簡要分析，認爲當前燃料乙醇技術存在的主要問題集中在發酵反應過程的控制、分離提純技術的應用兩個方面，針對這一問題應該從乙醇製備的整體角度出發，切實將發酵過程與提純過程結合在一起，從二者耦合的層面出發去解決。