一是撕書．一位赫赫有名的大學者將好端端的書撕掉, 似乎覺得有些不可思議, 但這卻是真的'．達爾文常常把某本書裏有參考價值的章節撕下來, 按照自己的分類將它們放到書架特定的位置上去, 這樣到要用的時候就可隨手拈來．雖然書被撕了顯得不大整齊, 但達爾文毫不在乎這些, 他藏書不是爲了擺樣子的, 只要有利於工作和研究就行了．
二是畫｀０＇．凡是當年到過達爾文書房的人都會發現, 達爾文的許多書後面都畫有一個｀０＇, 這是一種什麼特殊的記號呢? 原來是這樣的: 達爾文的藏書非常多, 哪些是讀過的, 哪些是沒讀過的；哪些是精讀過的, 哪些是隻略讀過的, 往往不容易分清楚．於是, 他就在未讀的書的後面畫上個｀０＇作爲記號, 以便有暇時把書讀完, 將｀０＇打破．對於已讀過的書, 達爾文也常常畫上各種記號或寫上評語, 比如在一些書的末尾, 他就標記着｀僅略讀過＇, 以便有機會時再精讀．各種記號一目瞭然, 讀書找書就都方便了．
三是編索引．達爾文很善於管理自己的圖書資料, 他總是堅持給自己的圖書資料編索引．他讀過書後還習慣於寫讀書摘要．有了索引和摘要, 他在研究和寫作時就能及時準確地找到急需的資料．正因爲達爾文善於管理和運用圖書資料, 所以他的著作旁徵博引, 廣採百家, 宏富精深．