工資超過個人所得稅起徵點後，就需要扣除個稅了。那麼工資怎麼扣稅呢?這主要與個人所得稅的起徵點、稅率、個稅收入相關。舉例來說，工資低於3500元的，不需要扣稅，超過3500的，按照不同個人所得稅稅率來扣稅。所以
2016年深圳工資扣稅標準爲3500元起。
1、工資扣除標準3500元/月(2011年9月1日起正式執行)(工資、薪金所得適用)
2、應納個人所得稅稅額=應納稅所得額×適用稅率-速算扣除數
應納稅所得額=扣除三險一金後月收入-扣除標準
交稅計算
工資個稅的計算公式爲：
應納稅額=(工資薪金所得 -“五險一金”-扣除數)×適用稅率-速算扣除數
個稅起徵點是3500，使用超額累進稅率的計算方法如下：
1、繳稅=全月應納稅所得額*稅率-速算扣除數
2、實發工資=應發工資-四金-繳稅
3、全月應納稅所得額=(應發工資-四金)-3500
4、扣除標準：個稅按3500元/月的起徵標準算
例：如果某人的工資收入爲5000元，他應納個人所得稅爲：(5000—3500)×3%—0=45(元)。
附：2016年深圳市解除勞動關係一次性補償收入免徵標準調高至243102元
根據個人所得稅管理的.相關規定：“個人因與用人單位解除勞動關係而取得的一次性補償收入，其收入在當地上年職工平均工資3倍數額以內的部分，免徵個人所得稅。”據此，我市個人與用人單位解除勞動關係取得一次性補償收入的免稅標準提高至243102元，較去年上調25149元。因此，納稅人在取得上述標準範圍內的離職補償，將能享受更多的稅收減免優惠。但對於超過的部分，仍需按有關規定計算徵收個人所得稅。
例：內地居民李先生在公司工作年限達15年，2016年7月其與公司解除勞務關係，獲得經濟補償金30萬元，應納稅款計算：
1.超過上年職工平均工資3倍數額以內的部分：
300000-243102(免稅額標準)=56898元
2.工作年限超過12年最多按12折算月工資收入：
56898/12= 4741.5元
3.再按稅法規定計算應納稅額：
[(4741.5-3500)×3%]×12 = 446.94元