安全評價過程控制管理手冊的編寫要有系統性，避免面面俱到、冗長重複。管理手冊不可能像具體工作標準或管理制度那樣詳盡，對各重要環節和控制要求只需概括地做出原則規定。在編寫時，要求文字準確、語言精練、結構嚴謹，還要通俗易懂，以便評價機構全體員工能理解和掌握。
編寫手冊時一般應遵循下列原則：
1)指令性原則
安全評價過程控制管理手冊應由機構最高管理者批准簽發。手冊的各項規定是機構全體員工(包括最高管理者)都必須遵守的內部法規，它能夠保證安全評價過程控制體系管理的連續性和有效性。因此，手冊各項規定具有指令性。
2)目的性原則
手冊應圍繞質量方針、目標，對爲實現安全評價質量方針、目標所要開展的各項活動做出規定。
3)符合性原則來源：
手冊應符合國家有關法規、條例、標準，同時還要與外部環境條件相適應。
4)系統性原則
手冊所闡述的.安全評價質量保障體系，應當具有整體性和層次性。手冊應就安全評價全程中影響安全評價的技術、管理和人員的各環節進行控制。手冊所闡述的安全評價過程控制體系，應當結構合理、接口明確、層次清楚，各項活動有序而且連續，要從整體出發，對安全評價機構執行的重要環節進行闡述，做出明確規定。
5)協調性原則
手冊中各項規定之間，手冊與機構其他安全評價檔案之間，必須協調一致。首先，手冊中各項規定要協調;其次，手冊與機構其他檔案(管理程序、標準、制度)之間要協調。無論是在手冊編寫階段，還是在體系執行階段，都應該及時記錄、處理手冊中的規定與目前管理制度中不一致的部分。
6)可行性原則
手冊中的規定，應從機構執行的實際情況出發，能夠做到或經過努力可以達到。某些規定，儘管內容先進，如果組織不具備實施條件，可暫不列入手冊中。
7)先進性原則
手冊的各項規定，應當在總結機構安全評價管理實踐經驗的基礎上，儘可能採用國內外的先進標準、技術和方法，加以科學化、規範化。
8)可檢查性原則
手冊的各項規定不但要明確，而且要有定量的考覈要求，便於實施監督和審覈，使編寫出來的手冊有可檢查性。也只有具有可檢查性與可考覈的手冊，方能真正被認真實施。手冊內容要簡練，重點要突出。
安全評價過程控制管理手冊一般應包括如下內容：
(1)安全評價過程控制方針目標;
(2)組織結構及安全評價管理工作的職責和權限;
(3)描述安全評價機構執行中涉及的重要環節;
(4)安全評價過程控制管理手冊的審批、管理和修改的規定。