醫師資格考試的合格線由國家衛生和計劃生育委員會醫師資格考試委員會確定，並於每年的12月間向社會公告。2014年公衛執業醫師資格考試醫學綜合筆試合格分數線公佈時間爲2014年12月31日。
1999～2014年公衛執業醫師資格考試醫學綜合筆試合格線分數線(公衛執業醫師綜合筆試滿分爲600分)：
2014年 公衛執業醫師考試合格線分數線 348
2013年 公衛執業醫師考試合格線分數線 330
2012年 公衛執業醫師考試合格線分數線 333
2011年 公衛執業醫師考試合格線分數線 332
2010年 公衛執業醫師考試合格線分數線 320
2009年 公衛執業醫師考試合格線分數線 330
2008年 公衛執業醫師考試合格線分數線 330
2007年 公衛執業醫師考試合格線分數線 305
2006年 公衛執業醫師考試合格線分數線 310
2005年 公衛執業醫師考試合格線分數線 312
2004年 公衛執業醫師考試合格線分數線 310
2003年 公衛執業醫師考試合格線分數線 300
2002年 公衛執業醫師考試合格線分數線 296
2001年 公衛執業醫師考試合格線分數線 296
2000年 公衛執業醫師考試合格線分數線 279
1999年 公衛執業醫師考試合格線分數線 280