在過去十多年中，中國股市經歷了一系列調整和變動，股票市場在國民經濟中的作用不斷增強，在中國的經濟和金融改革中扮演了一個重要的角色。恰當的理解股票市場在經濟演進過程中的變化以及這些變化的含義對於市場監管者和實際投資者都有着重要的意義。對市場之間的整合性的研究已引起了相當多理論研究者的注意，並且，國外學者在這方面已經做了相當多的實證研究，這其中大部分是以一些發達國家的金融市場爲對象的。
下文將以深市和滬市指數爲對象來研究兩個市場之間的關聯關係。因爲股票指數作爲一種統計指數，其本質功能是用平均值的變化來描述股票市場的動態變化，這是任何一種股票指數都必須具備的基本功能。在現實中經常發現的幾大股票市場的指數是先行的指數，存在着某種相互影響的關係，市場參與者都努力尋求如何透過股票市場的指數的變化去建立各國股票市場波動關係模型。本文也以此爲基礎做出一些實證分析。
數據說明
爲了分析兩個市場之間的關係，本文分別選取了滬深兩市中較有代表性的上證A股指數（SAZ）和深證A股指數（ZAZ），所有數據來自於中國經濟學教育科研網計量經濟論壇，包括從1995年12月19日至2005年6月17日期間2287個交易日的兩市的收盤指數。InZAZ和InSAZ分別指ZAZ和SAZ的對數值，△InZAZ和△InSAZ則分別是InZAZ和InSAZ的一階差分。所有的數據分析均使用EVIEWS3.1進行。
實證分析
在充分掌握兩市的時間序列和差分序列分佈之後，我們擬用協整檢驗以及誤差修正模型來從實證上分析這種關係。
（一）單位根檢驗
首先對兩市收盤指數的對數值進行單位根檢驗，以此確定時間序列的單整階數。透過分析可知，深證A股指數的收盤價和成交量的時間序列都是一階單整的，即InZAZt∶I（1）和InSAZt∶I（1）。
（二）協整檢驗
在做協整檢驗之前，我們首先進行Granger因果檢驗來確定兩市之間影響的因果關係。從檢驗的結果看，InZAZ和InSAZ之間存在雙向的格蘭傑因果關係，兩市的波動具有互相影響的作用。
然後對上述兩個變量檢驗是否存在協整關係，首先確定LNC和LNV的VAR模型的滯後期數。應用對數似然比統計量，我們計算得出以下結果
因此表明建立VAR(1)模型是可行的。進而，Johansen協整檢驗的結果表明確實存在着某種經濟機制制約着上證A股收盤指數和深證A股收盤指數之間變動，長期而言，它們的線性組合有向均衡收斂的趨勢：
其中νt表示長期穩定的偏差。
（三）建立誤差修正模型（ECM）
協整檢驗的結果表明我們可以使用ECM來進行長短期關係分析，兩市A股收盤指數之間的長期關係估計結果如下：
在長期均衡關係中，兩市A股的變化存在着不顯著的反向變化，常數項表示兩市A股指數之間的落差。
短期關係估計結果如下：
括號內的爲t統計量。透過上面兩個式子分析，可以發現深市A股的變化對滬市A股變化的.影響較大，且其係數的統計量較爲顯著（t=-1.91），而滬市A股變化對深市A股變化的影響則小，且這種影響不顯著，因其係數不顯著（t=0.84）。不過兩市A股長期均衡關係對兩市的影響則較爲顯著（t值分別爲-2.74和-3.67），儘管這種影響不是很強。