南京工業大學具有百年辦學歷史，是國家首批入選“高等學校創新能力提升計劃(2011計劃)”的14所高校之一，是江蘇省重點建設高校，江蘇省綜合改革試點高校，江蘇省人才強校試點高校，教育部首批卓越工程師培養計劃試點和專業學位研究生教育綜合改革試點高校。2013年1月，南京工業大學研究生部與學科建設辦公室合併組建成立研究生院，南工的研究生教育進入了一個嶄新的發展時期。
目前，學校共有一級學科博士學位授予點6個，二級學科博士學位授予點38個，一級學科碩士學位授予點20個，二級學科碩士學位授予點101個。現有國家一級重點學科1個，江蘇省一級學科國家重點學科培育建設點1個，江蘇高校國家重點學科培育建設點2個，江蘇高校優勢學科一期工程4項、二期工程6項，設有材料化學工程國家重點實驗室、國家生化工程技術研究中心、國家特種分離膜工程技術研究中心和國家熱管技術研究推廣中心等國家級科研機構4個，省部級研究中心21個，省部級重點實驗室16個。這些學科和科研平臺爲南工的研究生教育打下了堅實的基礎。
截止到2014年12月底，全校研究生教育規模已逾6700人(含全日制博士研究生473人、全日制碩士研究生5124人以及工程碩士1145人)，共有博士生導師118名和碩士生導師484名，其中中國科學院院士1人，中國工程院院士4人，全國傑出專業技術人才2人，教育部“長江學者”特聘教授6人，國家"973"計劃項目首席科學家8人，國家傑出青年基金獲得者8人，“十二五”“863”計劃專家委員會專家1人，主題專家組專家3人，全國模範教師2人，全國優秀教師4 人。高素質、高水平的研究生導師隊伍把南工的研究生教育推向了更高的臺階。
南工的研究生教育圍繞建設“綜合性、研究型、全球化”大學的總體目標，着力科學制定學校研究生教育和學科建設工作的基本任務指標，積極探索協同創新，加速提升高層次創新人才培養能力，全面提高研究生培養質量和學科建設水平。
南工的研究生教育質量穩步提高，並取得了可喜成績，共獲得全國百篇優秀博士學位論文1篇，提名5篇。南工培養的研究生因較高的學術水平、創新能力和實踐能力而受到用人單位的普遍讚譽，在全國高校、科研、企業等各條戰線上發揮着骨幹作用，爲國家的繁榮和科技的發展作出了重要貢獻，涌現出一大批優秀的科學家、科技工作者、工程技術人員和經濟管理人才。
南京工業大學研究生院將面向國家急需，世界一流，解放思想，凝心聚力，協同創新，開拓進取，繼續探索與國際接軌的高素質、高層次拔尖創新創業人才培養的新思路、新模式，把南工的研究生教育與學科建設的各項工作切實落到實處，在學校建設“綜合性、研究型、全球化”大學進程中繼續發揮重要作用，譜寫更加輝煌的篇章!